RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYP2C8P10632 490 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.851e-6■□□□□ 10.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STAT3P40763 770 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OAZ1P54368 228 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM173BQ6P4H8 233 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LBX2Q6XYB7 198 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BRAPQ7Z569 592 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DAGLBQ8NCG7 672 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 REPS2Q8NFH8 660 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTPN18Q99952 460 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TEX13BQ9BXU2 312 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.75□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADAMTS3O15072 1205 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PEX10O60683 326 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CFBP00751 764 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POLR2MP0CAP2 368 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP2B1P20020 1258 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SREBF2Q12772 1141 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBE2SQ16763 222 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TKFCQ3LXA3 575 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MCF2L2Q86YR7 1114 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CAPNS2Q96L46 248 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GBP4Q96PP9 640 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF146Q9NTX7 359 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM260Q9NX78 707 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BTBD7Q9P203 1132 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYH4Q9Y623 1939 aa9.74□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RASSF10A6NK89 507 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP2A1O14983 1001 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AOC2O75106 756 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOGQ13253 232 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPY5RQ15761 445 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MCTP2Q6DN12 878 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NSMFQ6X4W1 530 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFNL1Q8IU54 200 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TBC1D5Q92609 795 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHAMP1Q96JM3 812 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CFAP45Q9UL16 551 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RIPK3Q9Y572 518 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OTOFQ9HC10 1997 aa9.73□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM205CA6NFA0 338 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NFIBO00712 420 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNMDO75829 334 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A27O95847 323 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TM4SF4P48230 202 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRT85P78386 507 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q3C1V9 767 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MUM1L1Q5H9M0 696 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WDR78Q5VTH9 848 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHST13Q8NET6 341 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNFRSF25Q93038 417 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PGBD1Q96JS3 809 aa9.72□□□□□ -0.85
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZIC5Q96T25 663 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms