RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 RILPL1Q5EBL4 403 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 FBXO11Q86XK2 927 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 ERO1BQ86YB8 467 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 TNFRSF25Q93038 417 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 KIFC2Q96AC6 838 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 C12orf42Q96LP6 360 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 USP28Q96RU2 1077 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 AMNQ9BXJ7 453 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 GLT8D2Q9H1C3 349 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 NMRK2Q9NPI5 230 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 TMOD4Q9NZQ9 345 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.96□□□□□ -0.49
TRPS1-210ENST00000519815 TRAF5O00463 557 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 DPYSL4O14531 572 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 TRAK2O60296 914 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 YEATS4O95619 227 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 VCAM1P19320 739 aa11.95□□□□□ -0.5
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TRPS1-210ENST00000519815 ADCY7P51828 1080 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
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TRPS1-210ENST00000519815 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 LDLRAD1Q5T700 205 aa11.95□□□□□ -0.5
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TRPS1-210ENST00000519815 MOB2Q70IA6 237 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
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TRPS1-210ENST00000519815 TANGO6Q9C0B7 1094 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 ELP3Q9H9T3 547 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
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TRPS1-210ENST00000519815 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.94□□□□□ -0.5
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TRPS1-210ENST00000519815 HMGCS2P54868 508 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 SNAP25P60880 206 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 UBE2HP62256 183 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 FKBP1BP68106 108 aa11.94□□□□□ -0.5
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TRPS1-210ENST00000519815 GPIHBP1Q8IV16 184 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 SLC10A4Q96EP9 437 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 CLMNQ96JQ2 1002 aa11.94□□□□□ -0.5
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TRPS1-210ENST00000519815 PSTPIP2Q9H939 334 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF408Q9H9D4 720 aa11.94□□□□□ -0.5
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TRPS1-210ENST00000519815 FBXO28Q9NVF7 368 aa11.94□□□□□ -0.5
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TRPS1-210ENST00000519815 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 CLIC4Q9Y696 253 aa11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 DOCK1Q14185 1865 aa11.93□□□□□ -0.5
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TRPS1-210ENST00000519815 FLOT1O75955 427 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 MBD3O95983 291 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 TRAPPC10P48553 1259 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 SLC39A14Q15043 492 aa11.93□□□□□ -0.5
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TRPS1-210ENST00000519815 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 KCNG4Q8TDN1 519 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 CUL5Q93034 780 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
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TRPS1-210ENST00000519815 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa11.93□□□□□ -0.5
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TRPS1-210ENST00000519815 USP17L18D6R9N7 530 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 USP17L22D6RA61 530 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 USP17L19D6RCP7 530 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 USP17L20D6RJB6 530 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 ADAMTS3O15072 1205 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 SPTLC2O15270 562 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 ZBED4O75132 1171 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 ATP2B1P20020 1258 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 USP17L24Q0WX57 530 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 PPIL2Q13356 520 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 DGKZQ13574 1117 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 DSG2Q14126 1118 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 COG2Q14746 738 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
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