RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518848.5

HOXA-AS3-201, HOXA cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXA-AS3, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ICAM1P05362 532 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ALAS1P13196 640 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KCTD1Q719H9 257 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TMEM199Q8N511 208 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MORC4Q8TE76 937 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZMYM6O95789 1325 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZEB2O60315 1214 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CD4P01730 458 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NT5C2P49902 561 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PDE1AP54750 535 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 AAMPQ13685 434 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RASIP1Q5U651 963 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 VTA1Q9NP79 307 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NMT2O60551 498 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FGAP02671 866 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 VPS53Q5VIR6 699 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TTC14Q96N46 770 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 AP5M1Q9H0R1 490 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DNAJB2P25686 324 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TMEM240Q5SV17 173 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TLK2Q86UE8 772 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MYLIPQ8WY64 445 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 INCENPQ9NQS7 918 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ASTN1O14525 1302 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FOSL2P15408 326 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SMPD1P17405 629 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MUC3AQ02505 3323 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXA-AS3-201ENST00000518848 BEX3Q00994 111 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ITGA7Q13683 1181 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MAF1Q9H063 256 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CSF2RAP15509 400 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CCDC96Q2M329 555 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DUSP28Q4G0W2 176 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NSMFQ6X4W1 530 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TIFAQ96CG3 184 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZNF576Q9H609 170 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 IL23AQ9NPF7 189 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HERVK_113Q902F9 699 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FAM227BQ96M60 508 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MYO9BQ13459 2157 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 GRIN2DO15399 1336 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 A0A0D9SFI3 127 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SNHG28P0DPA3 235 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PDHBP11177 359 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SNAP25P60880 206 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 GRIN2CQ14957 1233 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZNF365Q70YC5 407 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HIPK3Q9H422 1215 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TOMM22Q9NS69 142 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SLC16A2P36021 539 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RGS22Q8NE09 1264 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DNERQ8NFT8 737 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms