RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 PNMA2Q9UL42 364 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A0D9SFI3 127 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 ADCY6O43306 1168 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 CABYRO75952 493 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC16A2P36021 539 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 NOVP48745 357 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 CDK7P50613 346 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC14Q96N46 770 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 KATNBL1Q9H079 304 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 BEX3Q00994 111 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 MFSD5Q6N075 450 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM199Q8N511 208 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 ZMYM6O95789 1325 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 EPHB4P54760 987 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 HAND2P61296 217 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 NKX3-2P78367 333 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 TLK2Q86UE8 772 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 Q9Y3F1 56 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 VTA1Q9NP79 307 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 TBX21Q9UL17 535 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF213O14771 459 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 SDSP20132 328 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 ESR2Q92731 530 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 LAMA3Q16787 3333 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 MCM3APO60318 1980 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 SMPD1P17405 629 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 SMC5Q8IY18 1101 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 B4DLN1 442 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 CTAGE5O15320 804 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 PDHBP11177 359 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 ITGA7Q13683 1181 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 HIP1O00291 1037 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 CALML3P27482 149 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 NT5C2P49902 561 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 IQCA1Q86XH1 822 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 ASTN1O14525 1302 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 CSF2RAP15509 400 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF543Q08ER8 600 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 MORC4Q8TE76 937 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 NFIBO00712 420 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 CD4P01730 458 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 FOSL2P15408 326 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-220ENST00000511663 PDE4DQ08499 809 aa22.6■■□□□ 1.21
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