RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509271.1

USP17L25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 17-like family member 25, humanhuman

APPRIS P2 BASIC

Gene USP17L25, Length 1,593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L25-201ENST00000509271 NBPF11Q86T75 865 aa11.74□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 SPICE1Q8N0Z3 855 aa11.74□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.74□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 PNMA1Q8ND90 353 aa11.74□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 MAF1Q9H063 256 aa11.74□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 KAT14Q9H8E8 782 aa11.74□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 EFCC1Q9HA90 598 aa11.74□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 GRPEL1Q9HAV7 217 aa11.74□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 VWA5AO00534 786 aa11.73□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 CNMDO75829 334 aa11.73□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 SLC25A27O95847 323 aa11.73□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 PDHBP11177 359 aa11.73□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 STAT2P52630 851 aa11.73□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 ZNF543Q08ER8 600 aa11.73□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 TRIM29Q14134 588 aa11.73□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 ASPRV1Q53RT3 343 aa11.73□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa11.73□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 REPS2Q8NFH8 660 aa11.73□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 PHKBQ93100 1093 aa11.73□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.73□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 RCOR1Q9UKL0 485 aa11.73□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 STRNO43815 780 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 YEATS4O95619 227 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 SMARCA1P28370 1054 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 PSMC4P43686 418 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 FOSBP53539 338 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 GUCY1B3Q02153 619 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 IRF5Q13568 498 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 KRT40Q6A162 431 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 OTOP1Q7RTM1 612 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 GAS2L3Q86XJ1 694 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 ABRAQ8N0Z2 381 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 CD99L2Q8TCZ2 262 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 ATG4CQ96DT6 458 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 SLC26A6Q9BXS9 759 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 MROH8Q9H579 483 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 TXNRD2Q9NNW7 524 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 RTEL1Q9NZ71 1219 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.72□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 SYCE3A1L190 88 aa11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 TMEM232C9JQI7 657 aa11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 ZBED4O75132 1171 aa11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 NASPP49321 788 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 FUT2Q10981 343 aa11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 TMTC3Q6ZXV5 915 aa11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 RIOX2Q8IUF8 465 aa11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 NUP133Q8WUM0 1156 aa11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 COA7Q96BR5 231 aa11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 TRIM47Q96LD4 638 aa11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 USP28Q96RU2 1077 aa11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 SPATC1LQ9H0A9 340 aa11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 FBXO28Q9NVF7 368 aa11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 BTBD7Q9P203 1132 aa11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 SRRDQ9UH36 339 aa11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 ZNF236Q9UL36 1845 aa11.71□□□□□ -0.53
USP17L25-201ENST00000509271 PCNTO95613 3336 aa11.71□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.71□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 PPFIA3O75145 1194 aa11.71□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 MMP1P03956 469 aa11.71□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 KIF5BP33176 963 aa11.71□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 Q3C1V9 767 aa11.71□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 TKFCQ3LXA3 575 aa11.71□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 KCNG4Q8TDN1 519 aa11.71□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 SOCS4Q8WXH5 440 aa11.71□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 TEX13BQ9BXU2 312 aa11.71□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 PTPN22Q9Y2R2 807 aa11.71□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 SLC15A5A6NIM6 579 aa11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 KIF28PB7ZC32 967 aa11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 HOXC6P09630 235 aa11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 XBP1P17861 261 aa11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 CTGFP29279 349 aa11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 STAT3P40763 770 aa11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 GRM4Q14833 912 aa11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 TMEM132BQ14DG7 1078 aa11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 DOCK3Q8IZD9 2030 aa11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 USP6NLQ92738 828 aa11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 PGBD1Q96JS3 809 aa11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 AIFM3Q96NN9 605 aa11.7□□□□□ -0.54
USP17L25-201ENST00000509271 LZTS2Q9BRK4 669 aa11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms