RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	STRN	O43815	780 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ERCC3	P19447	782 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	COG2	Q14746	738 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	EHD4	Q9H223	541 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	VCAN	P13611	3396 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.15	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	IGSF3	O75054	1194 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	RARB	P10826	455 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	RAG1	P15918	1043 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TLE2	Q04725	743 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	NR1H3	Q13133	447 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC41	Q15345	812 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR108	Q9NPR9	543 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	CLTB	P09497	229 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO45	P0C2W1	286 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	SEPT2	Q15019	361 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX17	Q15036	470 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF180	Q86T96	592 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	MROH8	Q9H579	483 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	COBL	O75128	1261 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	FLOT1	O75955	427 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	NR3C2	P08235	984 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	FCER1A	P12319	257 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMP2	P16035	220 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	FPGS	Q05932	587 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K12	Q12852	859 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	MCM6	Q14566	821 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PPM1E	Q8WY54	764 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	SHMT1	P34896	483 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PLCD1	P51178	756 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	MAML3	Q96JK9	1138 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC28	Q96AY4	2481 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PGK1	P00558	417 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIN2C	Q14957	1233 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	DACH1	Q9UI36	760 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PHF24	Q9UPV7	400 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	LTBP2	Q14767	1821 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	BCAR3	O75815	825 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM27	P14373	513 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGB8	P26012	769 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHB4	P54760	987 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	KCTD2	Q14681	263 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ATG4C	Q96DT6	458 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	MMP19	Q99542	508 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF576	Q9H609	170 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31

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