RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 TAF7LQ5H9L4 462 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 RTP2Q5QGT7 225 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 LMCD1Q9NZU5 365 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL20-204ENST00000489160 TEKQ02763 1124 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 CYP4F3Q08477 520 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 KSR1Q8IVT5 923 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 C1orf159Q96HA4 380 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 FKTNO75072 461 aa7.2□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.2□□□□□ -1.26
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CCL20-204ENST00000489160 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.2□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.2□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 TMEM82A0PJX8 343 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 PLD2O14939 933 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 THBDP07204 575 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 TKFCQ3LXA3 575 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 KREMEN2Q8NCW0 462 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 FRS2Q8WU20 508 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 RFPL3O75679 317 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 FUT4P22083 530 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 RPL10P27635 214 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 CD96P40200 585 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 GABREP78334 506 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 ZP2Q05996 745 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 TESK1Q15569 626 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 TMX1Q9H3N1 280 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 PLAAQ9Y263 795 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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CCL20-204ENST00000489160 PLS3P13797 630 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 PAMP19021 973 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 GYS2P54840 703 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 KCNAB2Q13303 367 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 PLCL1Q15111 1095 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 NTRK3Q16288 839 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 IQCEQ6IPM2 695 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 USP53Q70EK8 1073 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 ABI1Q8IZP0 508 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 NAT16Q8N8M0 369 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 DCAF4Q8WV16 495 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 PTPRN2Q92932 1015 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 CLEC1BQ9P126 229 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 BLACEA4D250 179 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 EFCAB14O75071 495 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 RAPGEF3O95398 923 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 TBC1D8O95759 1140 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 STYK1Q6J9G0 422 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 ZPBP2Q6X784 338 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 NINJ1Q92982 152 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 MMP19Q99542 508 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 PRKAB1Q9Y478 270 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD62A6NC57 917 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 KCNQ2O43526 872 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 LTBRP36941 435 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 DUSP4Q13115 394 aa7.15□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CCL20-204ENST00000489160 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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