RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 GPR160Q9UJ42 338 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 NUP155O75694 1391 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 TNFRSF10CO14798 259 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 IMPDH2P12268 514 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 CHRNEQ04844 493 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM192Q8IY95 271 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 TCFL5Q9UL49 500 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 MAGI2Q86UL8 1455 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 MEIS1O00470 390 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 SIGLEC6O43699 453 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 FKTNO75072 461 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 SYPP08247 313 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 SLC9A7Q96T83 725 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 ERBINQ96RT1 1412 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 CFPP27918 469 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 NR0B2Q15466 257 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 SP110Q9HB58 689 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 CHST7Q9NS84 486 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 NFIBO00712 420 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 TSPAN15O95858 294 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 VAMP1P23763 118 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 KCNK12Q9HB15 430 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 PPT2Q9UMR5 302 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 PZPP20742 1482 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 BBS9Q3SYG4 887 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 MAP6Q96JE9 813 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 TM9SF2Q99805 663 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 EBF1Q9UH73 591 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 KANK1Q14678 1352 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 MROH1Q8NDA8 1641 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 UNC13BO14795 1591 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 PSPNO60542 156 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM253P0C7T8 217 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 ACRP10323 421 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 PDE6BP35913 854 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 GALK1P51570 392 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 PAK2Q13177 524 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 SLC14A2Q15849 920 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF605Q86T29 641 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 CEP152O94986 1710 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 AGLP35573 1532 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 FAM135AQ9P2D6 1515 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM82A0PJX8 343 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 C9IYK1 514 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 C1QTNF9P0C862 333 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 GUCY2CP25092 1073 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 SNX17Q15036 470 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-211ENST00000484135 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.78□□□□□ -1.32
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