RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 MTMR8Q96EF0 704 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24.4■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.4■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 DDAH1O94760 285 aa24.4■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.4■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.4■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K14Q99558 947 aa24.4■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 MYL10Q9BUA6 226 aa24.4■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 RIOX1Q9H6W3 641 aa24.4■■□□□ 1.5
ACTB-211ENST00000480301 CCDC69A6NI79 296 aa24.39■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 SEPT4O43236 478 aa24.39■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 USH1GQ495M9 461 aa24.39■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.39■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.39■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 USP26Q9BXU7 913 aa24.39■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 MSCO60682 206 aa24.38■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.38■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 ASTN1O14525 1302 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 CYTH3O43739 400 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 ARMCX2Q7L311 632 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 FBXO11Q86XK2 927 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.37■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 ABCB11O95342 1321 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB5O15062 677 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 CPA1P15085 419 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 RGS22Q8NE09 1264 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 PIGSQ96S52 555 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 ASB14A6NK59 587 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 ANO1Q5XXA6 986 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 AMNQ9BXJ7 453 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 CALM1P0DP23 149 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 CALM2P0DP24 149 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 CALM3P0DP25 149 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 RXRAP19793 462 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 CALML3P27482 149 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 KIF5BP33176 963 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 RPS6P62753 249 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 ACVR2BQ13705 512 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D5Q92609 795 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 KATNBL1Q9H079 304 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 SMARCA1P28370 1054 aa24.33■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.33■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 HOMER1Q86YM7 354 aa24.33■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 MORC4Q8TE76 937 aa24.33■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 MAF1Q9H063 256 aa24.33■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.33■■□□□ 1.49
ACTB-211ENST00000480301 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.32■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.32■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 AKR1A1P14550 325 aa24.32■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.32■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 FANCBQ8NB91 859 aa24.32■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.32■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.32■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 OPLAHO14841 1288 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 COL6A1P12109 1028 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 PSMA5P28066 241 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 GNAQP50148 359 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 APOA5Q6Q788 366 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 MICU3Q86XE3 530 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 LCTP09848 1927 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 RPS6KB1P23443 525 aa24.3■■□□□ 1.48
ACTB-211ENST00000480301 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.3■■□□□ 1.48
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