RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 PRDM12Q9H4Q4 367 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ASTN1O14525 1302 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 GRIN2DO15399 1336 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ELP1O95163 1332 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 NAV1Q8NEY1 1877 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 SOWAHBA6NEL2 793 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 GRXCR2A6NFK2 248 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CD4P01730 458 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CST5P28325 142 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CYP2C18P33260 490 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 TJAP1Q5JTD0 557 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 GNASQ5JWF2 1037 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ARMCX2Q7L311 632 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 GPIHBP1Q8IV16 184 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 FAM126BQ8IXS8 530 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD35Q8N283 1001 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 DDX12PQ92771 950 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 DDRGK1Q96HY6 314 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 GLT1D1Q96MS3 346 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 DDX19BQ9UMR2 479 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 ROBO3Q96MS0 1386 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 CDH23Q9H251 3354 aa10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-208ENST00000479480 UMODL1Q5DID0 1318 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 M0R2C6 588 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 SNAP25P60880 206 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 NKX3-2P78367 333 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.84e-7■□□□□ 9.6
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 C20orf194Q5TEA3 1177 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 TSHZ3Q63HK5 1081 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 SLFN13Q68D06 897 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 SLC43A3Q8NBI5 491 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 VWCEQ96DN2 955 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 CEP95Q96GE4 821 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 AGBL1Q96MI9 1066 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 SLC24A3Q9HC58 644 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 INCENPQ9NQS7 918 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 PDGFCQ9NRA1 345 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 HOMER2Q9NSB8 354 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 MTMR4Q9NYA4 1195 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 FEM1BQ9UK73 627 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM232C9JQI7 657 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 TNFRSF10AO00220 468 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 MS4A1P11836 297 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 GIMAP6Q6P9H5 292 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 CXCL17Q6UXB2 119 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM199Q8N511 208 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 FAM133AQ8N9E0 248 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 KBTBD3Q8NAB2 608 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 CHST13Q8NET6 341 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 HERVK_113Q902F9 699 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 LRRCC1Q9C099 1032 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 SPC25Q9HBM1 224 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 IL23AQ9NPF7 189 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 ECHDC1Q9NTX5 307 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF536O15090 1300 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 GPAA1O43292 621 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 FGBP02675 491 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 APPP05067 770 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 BMP3P12645 472 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 MYOGP15173 224 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 SMPD1P17405 629 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 COL9A1P20849 921 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 RABGGTBP53611 331 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 CCL23P55773 120 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 PSMC6P62333 389 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 TFAP4Q01664 338 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 TNFAIP2Q03169 654 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 TAPT1Q6NXT6 567 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 OTOP2Q7RTS6 562 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 IFNL3Q8IZI9 196 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 NEDD1Q8NHV4 660 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-208ENST00000479480 APPBP2Q92624 585 aa10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms