RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 ARVCFO00192 962 aa22.73■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 TIMP1P01033 207 aa22.73■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 NOVP48745 357 aa22.73■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.73■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 RILPL2Q969X0 211 aa22.73■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.73■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.73■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.73■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 CTAGE5O15320 804 aa22.72■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 HAND2P61296 217 aa22.72■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.72■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 TBX21Q9UL17 535 aa22.72■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 ICAM1P05362 532 aa22.71■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.71■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.71■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.71■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 ASTN1O14525 1302 aa22.71■■□□□ 1.23
SHQ1-206ENST00000471526 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 PTGS1P23219 599 aa22.7■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.7■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 MFSD5Q6N075 450 aa22.7■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.7■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 TLK2Q86UE8 772 aa22.7■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.7■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 SMPD1P17405 629 aa22.69■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 NKX3-2P78367 333 aa22.69■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.69■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.69■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 MYLIPQ8WY64 445 aa22.69■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.69■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.68■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.68■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.68■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.68■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.68■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 TICAM2Q86XR7 235 aa22.68■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.68■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 CSF2RAP15509 400 aa22.67■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.67■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 TMEM199Q8N511 208 aa22.67■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.66■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 NFIBO00712 420 aa22.66■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 ZEB2O60315 1214 aa22.66■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 CABYRO75952 493 aa22.66■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 PDHBP11177 359 aa22.66■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 SDSP20132 328 aa22.66■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.66■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 VTA1Q9NP79 307 aa22.66■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 MCM3APO60318 1980 aa22.65■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 ZMYM6O95789 1325 aa22.65■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 CD4P01730 458 aa22.65■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 ACRP10323 421 aa22.65■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 CYP2C18P33260 490 aa22.65■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 ITGA7Q13683 1181 aa22.65■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 TMEM240Q5SV17 173 aa22.65■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.65■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 SMC5Q8IY18 1101 aa22.65■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 TTC14Q96N46 770 aa22.65■■□□□ 1.22
SHQ1-206ENST00000471526 CALML3P27482 149 aa22.64■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.64■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.64■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 MORC4Q8TE76 937 aa22.64■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.64■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 Q9Y3F1 56 aa22.64■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 GRIN2DO15399 1336 aa22.63■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.63■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF213O14771 459 aa22.63■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 IGHDP01880 384 aa22.63■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 FOSL2P15408 326 aa22.63■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 DNAJB2P25686 324 aa22.63■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 PSMC6P62333 389 aa22.63■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF543Q08ER8 600 aa22.63■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 AAMPQ13685 434 aa22.63■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF365Q70YC5 407 aa22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms