RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF627Q7L945 461 aa3.59□□□□□ -1.83
SHQ1-204ENST00000468347 ADOQ96SZ5 270 aa3.59□□□□□ -1.83
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SHQ1-204ENST00000468347 FBXO24O75426 580 aa3.58□□□□□ -1.84
SHQ1-204ENST00000468347 ATG7O95352 703 aa3.58□□□□□ -1.84
SHQ1-204ENST00000468347 CDK4P11802 303 aa3.58□□□□□ -1.84
SHQ1-204ENST00000468347 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
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SHQ1-204ENST00000468347 ADAM30Q9UKF2 790 aa3.58□□□□□ -1.84
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SHQ1-204ENST00000468347 A0A1W2PQC6 194 aa3.57□□□□□ -1.84
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1W2PQD8 194 aa3.57□□□□□ -1.84
SHQ1-204ENST00000468347 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
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SHQ1-204ENST00000468347 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
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SHQ1-204ENST00000468347 B4GALT4O60513 344 aa3.49□□□□□ -1.85
SHQ1-204ENST00000468347 TACR1P25103 407 aa3.49□□□□□ -1.85
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SHQ1-204ENST00000468347 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SHQ1-204ENST00000468347 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa3.49□□□□□ -1.85
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