RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 CCL15Q16663 113 aa27.79■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 BRI3BPQ8WY22 251 aa27.79■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 CUL5Q93034 780 aa27.79■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 TMEM88BA6NKF7 163 aa27.78■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 BICD2Q8TD16 824 aa27.78■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP27.78■■■□□ 2.041e-11■■■■■ 53.6
NME4-209ENST00000460297 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 NCLP19338 710 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 TMEM132BQ14DG7 1078 aa27.78■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 NFKBIBQ15653 356 aa27.78■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 UBE2SQ16763 222 aa27.78■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa27.78■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 USP28Q96RU2 1077 aa27.78■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 GDPD2Q9HCC8 539 aa27.78■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 MCM4P33991 863 aa27.77■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 CLK2P49760 499 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 KRT85P78386 507 aa27.77■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.041e-8■■■■□ 22.1
NME4-209ENST00000460297 TMEM260Q9NX78 707 aa27.77■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 ABCB11O95342 1321 aa27.77■■■□□ 2.04
NME4-209ENST00000460297 MEIS2O14770 477 aa27.76■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 USP17L6PQ6QN14 398 aa27.76■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 GLT8D2Q9H1C3 349 aa27.76■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 BTBD19C9JJ37 291 aa27.75■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 ATP2A1O14983 1001 aa27.75■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 OAZ1P54368 228 aa27.75■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 HERVK_113P62684 666 aa27.75■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa27.75■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 ATL3Q6DD88 541 aa27.75■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 LBX2Q6XYB7 198 aa27.75■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 FIBPO43427 364 aa27.75■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 SLC10A3P09131 477 aa27.75■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 RIPK3Q9Y572 518 aa27.75■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa27.74■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 ALAS1P13196 640 aa27.74■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 OSBPP22059 807 aa27.74■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 RILPL1Q5EBL4 403 aa27.74■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 CLEC4DQ8WXI8 215 aa27.74■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 TBC1D5Q92609 795 aa27.74■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 PTPN18Q99952 460 aa27.74■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 CFAP45Q9UL16 551 aa27.74■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 PNMA2Q9UL42 364 aa27.74■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 CLIC4Q9Y696 253 aa27.74■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 PDHXO00330 501 aa27.73■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 PEX10O60683 326 aa27.73■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 NBR1Q14596 966 aa27.73■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 KRT25Q7Z3Z0 450 aa27.73■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 ANKRD23Q86SG2 305 aa27.73■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 BTBD7Q9P203 1132 aa27.73■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa27.73■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 WNT7AO00755 349 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 MUM1L1Q5H9M0 696 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 FAM43AQ8N2R8 423 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 MB21D1Q8N884 522 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 HHIPL1Q96JK4 782 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 PGBD1Q96JS3 809 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 TEX13BQ9BXU2 312 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 HOMER2Q9NSB8 354 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 POLR3EQ9NVU0 708 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 RTEL1Q9NZ71 1219 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 PIK3CDO00329 1044 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 NFIBO00712 420 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 MYH7BA7E2Y1 1941 aa27.71■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 CFBP00751 764 aa27.71■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 CYP2C8P10632 490 aa27.71■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 ATP2B1P20020 1258 aa27.71■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 STAT3P40763 770 aa27.71■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP27.71■■■□□ 2.035e-8■■■■□ 23.5
NME4-209ENST00000460297 INF2Q27J81 1249 aa27.71■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 ANO1Q5XXA6 986 aa27.71■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 PNMA3Q9UL41 463 aa27.71■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa27.71■■■□□ 2.03
NME4-209ENST00000460297 CNMDO75829 334 aa27.7■■■□□ 2.02
NME4-209ENST00000460297 NASPP49321 788 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
NME4-209ENST00000460297 PLS1Q14651 629 aa27.7■■■□□ 2.02
NME4-209ENST00000460297 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
NME4-209ENST00000460297 TMEM87AQ8NBN3 555 aa27.7■■■□□ 2.02
NME4-209ENST00000460297 TRERF1Q96PN7 1200 aa27.7■■■□□ 2.02
NME4-209ENST00000460297 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
NME4-209ENST00000460297 GOLGA6L22H0YM25 854 aa27.69■■■□□ 2.02
NME4-209ENST00000460297 CCDC102AQ96A19 550 aa27.69■■■□□ 2.02
NME4-209ENST00000460297 SPATA32Q96LK8 384 aa27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms