RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 JMJD4Q9H9V9 463 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF536O15090 1300 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 ICAM1P05362 532 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 ERCC3P19447 782 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 SNAP25P60880 206 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 TMTC3Q6ZXV5 915 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 NCAPG2Q86XI2 1143 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 MTMR8Q96EF0 704 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 BRCA2P51587 3418 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 NID2Q14112 1375 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 PLEKHH3Q7Z736 793 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 GJD2Q9UKL4 321 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 PLXNB2O15031 1838 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 ZBTB5O15062 677 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 CYTH3O43739 400 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 STRNO43815 780 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 PLEKHA8P1O95397 391 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC4A3P48751 1232 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAF1Q13077 416 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 WDR78Q5VTH9 848 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR142Q7Z601 462 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 CHST13Q8NET6 341 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 AGBL1Q96MI9 1066 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 DEFB118Q96PH6 123 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXO40Q9UH90 709 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 CCPG1Q9ULG6 757 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 TFRCP02786 760 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 HMGCRP04035 888 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC35G1Q2M3R5 365 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 QRICH1Q2TAL8 776 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 TPCN1Q9ULQ1 816 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 RIPK3Q9Y572 518 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 NR2E3Q9Y5X4 410 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-205ENST00000450873 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 ST18O60284 1047 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 ALAS1P13196 640 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 PTPREP23469 700 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 CDC27P30260 824 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 ADD1P35611 737 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXO11Q86XK2 927 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 ABRAQ8N0Z2 381 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 TRERF1Q96PN7 1200 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 PIGSQ96S52 555 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP12.27□□□□□ -0.451e-17■■■□□ 18.8
RABGEF1-205ENST00000450873 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC15A5A6NIM6 579 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 FCER1AP12319 257 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 CCT2P78371 535 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 HOMER1Q86YM7 354 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 SOCS4Q8WXH5 440 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 AMNQ9BXJ7 453 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 PFKFB2O60825 505 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 CHRDL2Q6WN34 429 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC82Q8N4S0 544 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKLE1Q8NAG6 615 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 NUDT12Q9BQG2 462 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 ACAD9Q9H845 621 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF146Q9NTX7 359 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCB11O95342 1321 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 RPTORQ8N122 1335 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 CPLX1O14810 134 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 FUT2Q10981 343 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 STK3Q13188 491 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 GRB14Q14449 540 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 KCTD2Q14681 263 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 MORN1Q5T089 497 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 MMP19Q99542 508 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 HOMER2Q9NSB8 354 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 IFNAR1P17181 557 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 USH1GQ495M9 461 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 PIBF1Q8WXW3 757 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 MAF1Q9H063 256 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC5A4Q9NY91 659 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 V9GY48 417 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-205ENST00000450873 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms