RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

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Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SHOXO15266 292 aa7.29□□□□□ -1.24
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYP4F8P98187 520 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RTP2Q5QGT7 225 aa7.29□□□□□ -1.24
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NBPF4Q96M43 638 aa7.29□□□□□ -1.24
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RAB3GAP1Q15042 981 aa7.28□□□□□ -1.24
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 JMJD8Q96S16 334 aa7.28□□□□□ -1.24
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.28□□□□□ -1.24
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DCAF15Q66K64 600 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MKL1Q969V6 931 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1W2PQ27 194 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1W2PQ64 194 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1W2PQC6 194 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1W2PQD8 194 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD247P20963 164 aa7.21□□□□□ -1.26
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