RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 RDH13Q8NBN7 331 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 GSDMAQ96QA5 445 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 ABCC12Q96J65 1359 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 SHROOM2Q13796 1616 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 PDE8BO95263 885 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 ADCY8P40145 1251 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 ADAM9Q13443 819 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 PPP2R5AQ15172 486 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 SLFN13Q68D06 897 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 LMNB2Q03252 620 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 MAP4K1Q92918 833 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 HESX1Q9UBX0 185 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 TMOD1P28289 359 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 MFAP3P55082 362 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 THAP12O43422 761 aa14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 H2AFZP0C0S5 128 aa14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 ABCB4P21439 1286 aa14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 MYL7Q01449 175 aa14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 H2AFVQ71UI9 128 aa14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 PASKQ96RG2 1323 aa14.35□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 KIF3CO14782 793 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 SCRN1Q12765 414 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 LRRC24Q50LG9 513 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 RETREG2Q8NC44 543 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 RILPQ96NA2 401 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 AMNQ9BXJ7 453 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 NLRP1Q9C000 1473 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 CAPN9O14815 690 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 OATP04181 439 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 ATF2P15336 505 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 CEP120Q8N960 986 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 MED4Q9NPJ6 270 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 ST7Q9NRC1 585 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 STK17AQ9UEE5 414 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 ERCC3P19447 782 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 PIK3CAP42336 1068 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 USP14P54578 494 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 NDUFA8P51970 172 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 UIMC1Q96RL1 719 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 PTGDRQ13258 359 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.33□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.33□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.33□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.33□□□□□ -0.11
TNS1-207ENST00000430930 KCNQ3O43525 872 aa14.33□□□□□ -0.12
TNS1-207ENST00000430930 SLC39A14Q15043 492 aa14.33□□□□□ -0.12
TNS1-207ENST00000430930 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.33□□□□□ -0.12
TNS1-207ENST00000430930 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.33□□□□□ -0.12
TNS1-207ENST00000430930 GADL1Q6ZQY3 521 aa14.33□□□□□ -0.12
TNS1-207ENST00000430930 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.33□□□□□ -0.12
TNS1-207ENST00000430930 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
TNS1-207ENST00000430930 CLIC4Q9Y696 253 aa14.33□□□□□ -0.12
TNS1-207ENST00000430930 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms