RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.27□□□□□ -0.12
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KIF18AQ8NI77 898 aa14.27□□□□□ -0.12
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DNAI1Q9UI46 699 aa14.27□□□□□ -0.12
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A0A0U1RQJ8 604 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SOWAHDA6NJG2 315 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USP17L15C9J2P7 530 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USP17L11C9JVI0 530 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USP17L18D6R9N7 530 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USP17L22D6RA61 530 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USP17L19D6RCP7 530 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USP17L20D6RJB6 530 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 N4BP3O15049 544 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USP17L24Q0WX57 530 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FANCGO15287 622 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KLRC4O43908 158 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SNHG28P0DPA3 235 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FCER1AP12319 257 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SWAP70Q9UH65 585 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MYO1BO43795 1136 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CASP14P31944 242 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ERCC3P19447 782 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RXRBP28702 533 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ASIC1P78348 528 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 JAG1P78504 1218 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CALCRLQ16602 461 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KCNJ18B7U540 433 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC1A4P43007 532 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KCNJ12Q14500 433 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DYMQ7RTS9 669 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MYH4Q9Y623 1939 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CLRN2A0PK11 232 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 YDJCA8MPS7 323 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PDE4DQ08499 809 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 STK4Q13043 487 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARHGAP6O43182 974 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPIP5K2O43314 1243 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MCM6Q14566 821 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADSSL1Q8N142 457 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RMND1Q9NWS8 449 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LAD1O00515 517 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RAD17O75943 681 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GYPCP04921 128 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRPHP41219 470 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USH1GQ495M9 461 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRIM47Q96LD4 638 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRIM9Q9C026 710 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZBTB5O15062 677 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SMARCA1P28370 1054 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLFN13Q68D06 897 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms