RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOWAHBA6NEL2 793 aa15.63■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERC2O15083 957 aa15.63■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD4P01730 458 aa15.63■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACRP10323 421 aa15.63■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PBX2P40425 430 aa15.63■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.63■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa15.63■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa15.63■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TLK2Q86UE8 772 aa15.63■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRERF1Q96PN7 1200 aa15.63■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STX8Q9UNK0 236 aa15.63■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRXCR1A8MXD5 290 aa15.62■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLA2G6O60733 806 aa15.62■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CABYRO75952 493 aa15.62■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALAS1P13196 640 aa15.62■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCCP23508 829 aa15.62■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXCL17Q6UXB2 119 aa15.62■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF365Q70YC5 407 aa15.62■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCTD1Q719H9 257 aa15.62■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.62■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHMP4CQ96CF2 233 aa15.62■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GBF1Q92538 1859 aa15.62■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPY2A6NKD2 308 aa15.61■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP2C18P33260 490 aa15.61■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASGRP2Q7LDG7 609 aa15.61■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL23AQ9NPF7 189 aa15.61■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC28Q96AY4 2481 aa15.6■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMPD1P17405 629 aa15.6■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TJAP1Q5JTD0 557 aa15.6■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RCSD1Q6JBY9 416 aa15.6■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP5M1Q9H0R1 490 aa15.6■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIPK3Q9H422 1215 aa15.6■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.6■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP39A1Q9NYL5 469 aa15.6■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR12Q9ULL5 1215 aa15.6■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHD9Q3L8U1 2897 aa15.6■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXP2O15409 715 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZEB2O60315 1214 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NMT2O60551 498 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTGS1P23219 599 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNAP25P60880 206 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTDSPL2Q05D32 466 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGA7Q13683 1181 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB30Q15771 203 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MUM1L1Q5H9M0 696 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HERVK_113Q902F9 699 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCPG1Q9ULG6 757 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRIN2DO15399 1336 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UMODL1Q5DID0 1318 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MX1P20591 662 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IQSEC1Q6DN90 963 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAPT1Q6NXT6 567 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NSMFQ6X4W1 530 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EEPD1Q7L9B9 569 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRDM12Q9H4Q4 367 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VTA1Q9NP79 307 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRDM6Q9NQX0 595 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDGFCQ9NRA1 345 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q9Y3F1 56 aa15.59■□□□□ 0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B4GALT4O60513 344 aa15.58■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ICAM1P05362 532 aa15.58■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC96Q2M329 555 aa15.58■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MORC4Q8TE76 937 aa15.58■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCAF4Q8WV16 495 aa15.58■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INCENPQ9NQS7 918 aa15.58■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSRAQ9UJ68 235 aa15.58■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTMR7Q9Y216 660 aa15.58■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGBP02675 491 aa15.57■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOVP48745 357 aa15.57■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCL23P55773 120 aa15.57■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMC6P62333 389 aa15.57■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.57■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM63BQ5T3F8 832 aa15.57■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPM1EQ8WY54 764 aa15.57■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRPV6Q9H1D0 765 aa15.57■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.57■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa15.57■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANAPC4Q9UJX5 808 aa15.57■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa15.57■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SALL3Q9BXA9 1300 aa15.56■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ORC4O43929 436 aa15.56■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS53Q5VIR6 699 aa15.56■□□□□ 0.08
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms