RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411355.1

RNU6-954P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 954, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-954P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZBED9Q6R2W3 1325 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 BMP8BP34820 402 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 PTPRKQ15262 1439 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 FBXW10Q5XX13 1052 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 RUFY4Q6ZNE9 571 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 SLCO6A1Q86UG4 719 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 CNTD2Q9H8S5 307 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 SIRT5Q9NXA8 310 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 PPT2Q9UMR5 302 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 ITSN2Q9NZM3 1697 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 WDR62O43379 1518 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 TEX14Q8IWB6 1497 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 NUDT19A8MXV4 375 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 H0Y8X5 98 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 TP53P04637 393 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 VAV1P15498 845 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 PNLIPP16233 465 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 PRKCAP17252 672 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 BMP7P18075 431 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 RTP2Q5QGT7 225 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 C7orf61Q8IZ16 206 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 NUP43Q8NFH3 380 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 BRF1Q92994 677 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 C20orf173Q96LM9 149 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 FERD3LQ96RJ6 166 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 JMJD8Q96S16 334 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 BCL11AQ9H165 835 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 IMPACTQ9P2X3 320 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 KIF14Q15058 1648 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 ADAMTS12P58397 1594 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 PDS5BQ9NTI5 1447 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 GSTM1P09488 218 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 HOXA5P20719 270 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 CDR1P51861 262 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 CTSWP56202 376 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 ERVFRD-1P60508 538 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 RACK1P63244 317 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 VMACQ2NL98 169 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF385BQ569K4 471 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 TMCO4Q5TGY1 634 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 TCERG1LQ5VWI1 586 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 GALNT18Q6P9A2 607 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 CCDC81Q6ZN84 652 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 TMC6Q7Z403 805 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 NAT16Q8N8M0 369 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 TMEM52Q8NDY8 209 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 SIGLEC10Q96LC7 697 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 KLHL14Q9P2G3 628 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 IRAK3Q9Y616 596 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 CCDC7Q96M83 1385 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 CROCC2H7BZ55 1655 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 WASHC2AQ641Q2 1341 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 ADCY10Q96PN6 1610 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 B8ZZF3 427 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 RFXAPO00287 272 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRIM13O60858 407 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 MSL3P1P0C860 447 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 PMS1P54277 932 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 NCKAP1LP55160 1127 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 CYP4F8P98187 520 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 RAB3GAP1Q15042 981 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 SLC12A9Q9BXP2 914 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 MBD5Q9P267 1494 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 NCANO14594 1321 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 HRKO00198 91 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 N4BP3O15049 544 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 MPOP05164 745 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 GSNP06396 782 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 ARL4AP40617 200 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF445P59923 1031 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 YBX1P67809 324 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-954P-201ENST00000411355 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms