RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRR31Q5SQ13 230 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 C11orf87Q6NUJ2 197 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAQR3Q6TCH7 311 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 C18orf65Q6ZTR6 163 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 FUKQ8N0W3 1084 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPCN2Q8NHX9 752 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 CPA5Q8WXQ8 436 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIK3R5Q8WYR1 880 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa0.16□□□□□ -2.38
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RNU6-172P-201ENST00000411000 RBPJLQ9UBG7 517 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 EGFL7Q9UHF1 273 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZMYM5Q9UJ78 669 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACSL6Q9UKU0 697 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-172P-201ENST00000411000 B3GALT2O43825 422 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 CES1P23141 567 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 PMLP29590 882 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 AWAT2Q6E213 333 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CDC37L1Q7L3B6 337 aa0.15□□□□□ -2.39
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RNU6-172P-201ENST00000411000 TTLL6Q8N841 843 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 MFSD2AQ8NA29 543 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 KYQ8NBH2 561 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 FRS2Q8WU20 508 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALG3Q92685 438 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 MARK4Q96L34 752 aa0.15□□□□□ -2.39
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RNU6-172P-201ENST00000411000 LMF1Q96S06 567 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP0.15□□□□□ -2.39
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RNU6-172P-201ENST00000411000 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 A6NJR5 290 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 FANCGO15287 622 aa0.14□□□□□ -2.39
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RNU6-172P-201ENST00000411000 PRR5P85299 388 aa0.14□□□□□ -2.39
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RNU6-172P-201ENST00000411000 TAX1BP1Q86VP1 789 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 SH2D3CQ8N5H7 860 aa0.14□□□□□ -2.39
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RNU6-172P-201ENST00000411000 RIN3Q8TB24 985 aa0.14□□□□□ -2.39
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBTB37Q5TC79 503 aa0.13□□□□□ -2.39
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RNU6-172P-201ENST00000411000 RHOUQ7L0Q8 258 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRP10Q7Z4F1 713 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLHL36Q8N4N3 616 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 BEND2Q8NDZ0 799 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 PMEPA1Q969W9 287 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 LENG9Q96B70 501 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC37BQ96QE4 947 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 EBF3Q9H4W6 596 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 ELP3Q9H9T3 547 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF521Q96K83 1311 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-172P-201ENST00000411000 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
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