RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-202ENST00000402738 ANLNQ9NQW6 1124 aa10.71□□□□□ -0.69
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HERC3-202ENST00000402738 CHMP2AO43633 222 aa10.71□□□□□ -0.7
HERC3-202ENST00000402738 GCNT3O95395 438 aa10.71□□□□□ -0.7
HERC3-202ENST00000402738 PHBP35232 272 aa10.71□□□□□ -0.7
HERC3-202ENST00000402738 PTGDRQ13258 359 aa10.71□□□□□ -0.7
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HERC3-202ENST00000402738 HDAC6Q9UBN7 1215 aa10.71□□□□□ -0.7
HERC3-202ENST00000402738 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa10.71□□□□□ -0.7
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HERC3-202ENST00000402738 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
HERC3-202ENST00000402738 DCUN1D2Q6PH85 259 aa10.7□□□□□ -0.7
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HERC3-202ENST00000402738 FAM89AQ96GI7 184 aa10.68□□□□□ -0.7
HERC3-202ENST00000402738 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
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HERC3-202ENST00000402738 ECT2Q9H8V3 914 aa10.68□□□□□ -0.7
HERC3-202ENST00000402738 IFT122Q9HBG6 1241 aa10.68□□□□□ -0.7
HERC3-202ENST00000402738 CD248Q9HCU0 757 aa10.68□□□□□ -0.7
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