RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 BICDL2A1A5D9 508 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 SMCO2A6NFE2 343 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 MSANTD4Q8NCY6 345 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 LY75O60449 1722 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 PES1O00541 588 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 ABL1P00519 1130 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 PIP4K2BP78356 416 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 LETM2Q2VYF4 491 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC15Q8TF66 581 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 C7orf25Q9BPX7 421 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 FUT8Q9BYC5 575 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 PLCG2P16885 1265 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 CCNE1P24864 410 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 TXNRD1Q16881 649 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 SOGA3Q5TF21 947 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 NEK8Q86SG6 692 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 TEX11Q8IYF3 940 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 EXOC1Q9NV70 894 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 LONRF2Q1L5Z9 754 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 SLC51AQ86UW1 340 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 FAM114A1Q8IWE2 563 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 CNBD1Q8NA66 436 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 P2RX5Q93086 422 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM9Q9C026 710 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 RAB21Q9UL25 225 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXD13-201ENST00000392539 SRGNP10124 158 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 NUP58Q9BVL2 599 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 HAUS4Q9H6D7 363 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 AMPD3Q01432 767 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 PDE4DQ08499 809 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 TRAPPC3LQ5T215 181 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 CD209Q9NNX6 404 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 CTAGE15A4D2H0 777 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 CTAGE8P0CG41 777 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 CTAGE6Q86UF2 777 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 CTAGE4Q8IX94 777 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 CPVLQ9H3G5 476 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 GPSM2P81274 684 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 RETREG2Q8NC44 543 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 ASIC1P78348 528 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 USP17L2Q6R6M4 530 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 MYO6Q9UM54 1294 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 B4DLN1 442 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 ERLIN1O75477 346 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 ATP2B4P23634 1241 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 OAS2P29728 719 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 AMPD2Q01433 879 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 NGLY1Q96IV0 654 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 FOCADQ5VW36 1801 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 ESYT2A0FGR8 921 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 IL1R1P14778 569 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 MEA1Q16626 185 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 SLF2Q8IX21 1173 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 GUCA1BQ9UMX6 200 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC66A2RUB6 948 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 CYP2C19P33261 490 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 KRT83P78385 493 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 COBLL1Q53SF7 1204 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 WDR59Q6PJI9 974 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF662Q6ZS27 426 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 CALML4Q96GE6 196 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 UFL1O94874 794 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 TECP42680 631 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 ANKRD40Q6AI12 368 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 C8orf37Q96NL8 207 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 hCG_1984214I3L0E3 225 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 MAP2K7O14733 419 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 TUBBP07437 444 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 NOVP48745 357 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 CNNM4Q6P4Q7 775 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 TBCKQ8TEA7 893 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 CEP95Q96GE4 821 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 PIGSQ96S52 555 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 TTYH3Q9C0H2 523 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 PSMD14O00487 310 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 STK4Q13043 487 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
HOXD13-201ENST00000392539 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
HOXD13-201ENST00000392539 PNKPQ96T60 521 aa29.51■■■□□ 2.31
HOXD13-201ENST00000392539 VAT1LQ9HCJ6 419 aa29.51■■■□□ 2.31
HOXD13-201ENST00000392539 GGA1Q9UJY5 639 aa29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms