RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLF1Q9BQI6 1058 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.53□□□□□ -1.36
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RNU6-171P-201ENST00000384354 RASA1P20936 1047 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADD2P35612 726 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
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RNU6-171P-201ENST00000384354 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
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RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
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RNU6-171P-201ENST00000384354 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-171P-201ENST00000384354 DMDP11532 3685 aa6.53□□□□□ -1.36
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RNU6-171P-201ENST00000384354 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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RNU6-171P-201ENST00000384354 KLRC3Q07444 240 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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RNU6-171P-201ENST00000384354 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 BOLA2Q9H3K6 86 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.52□□□□□ -1.37
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RNU6-171P-201ENST00000384354 CEP95Q96GE4 821 aa6.51□□□□□ -1.37
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RNU6-171P-201ENST00000384354 KAT6AQ92794 2004 aa6.5□□□□□ -1.37
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RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 PANK1Q8TE04 598 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC17Q96LX7 622 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 UIMC1Q96RL1 719 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 INCENPQ9NQS7 918 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 PAG1Q9NWQ8 432 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLIP2Q9UDT6 1046 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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RNU6-171P-201ENST00000384354 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 M0R2C6 588 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 NFIBO00712 420 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-171P-201ENST00000384354 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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