RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 MGAMO43451 1857 aa27.16■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 MUM1L1Q5H9M0 696 aa27.16■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 WASF1Q92558 559 aa27.16■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 WBP1LQ9NX94 342 aa27.16■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 PNMA2Q9UL42 364 aa27.16■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa27.15■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 ABCB11O95342 1321 aa27.15■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 hCG_1984214I3L0E3 225 aa27.15■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 OPLAHO14841 1288 aa27.15■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 FAM184AQ8NB25 1140 aa27.15■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 CLEC4DQ8WXI8 215 aa27.15■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 TRERF1Q96PN7 1200 aa27.15■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 RNF146Q9NTX7 359 aa27.15■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 DOCK3Q8IZD9 2030 aa27.15■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 ERCC3P19447 782 aa27.14■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 PLXNB2O15031 1838 aa27.14■■□□□ 1.94
PDSS1-201ENST00000376215 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 SLC25A27O95847 323 aa27.13■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 FOSBP53539 338 aa27.13■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 NAPAP54920 295 aa27.13■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 CCNA1P78396 465 aa27.13■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 TKFCQ3LXA3 575 aa27.13■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 NCAPG2Q86XI2 1143 aa27.13■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 EFCC1Q9HA90 598 aa27.13■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 NFIBO00712 420 aa27.12■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 TRAF1Q13077 416 aa27.12■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 SHCBP1Q8NEM2 672 aa27.12■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 SH3GLB2Q9NR46 395 aa27.12■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 PPP1R18Q6NYC8 613 aa27.12■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 JMYQ8N9B5 988 aa27.12■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 CHST13Q8NET6 341 aa27.11■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 BEGAINQ9BUH8 593 aa27.11■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 ACAD9Q9H845 621 aa27.11■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 TSKSQ9UJT2 592 aa27.11■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 KCNJ14Q9UNX9 436 aa27.11■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 LCTP09848 1927 aa27.11■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 ADAMTS3O15072 1205 aa27.1■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 COPB2P35606 906 aa27.1■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 TBC1D5Q92609 795 aa27.1■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 MROH8Q9H579 483 aa27.1■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 CTGFP29279 349 aa27.09■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 NPY5RQ15761 445 aa27.09■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 C8orf76Q96K31 380 aa27.09■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 PHF20Q9BVI0 1012 aa27.09■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 ZMYND12Q9H0C1 365 aa27.09■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 KIF3AQ9Y496 699 aa27.09■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 SMCO2A6NFE2 343 aa27.08■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 GPR25O00155 361 aa27.08■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 WDR78Q5VTH9 848 aa27.08■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC148Q8NFR7 591 aa27.08■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 FBXO40Q9UH90 709 aa27.08■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 ESYT2A0FGR8 921 aa27.08■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 GUCY1B3Q02153 619 aa27.08■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 KRT40Q6A162 431 aa27.08■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP27.08■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa27.08■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 PSTPIP2Q9H939 334 aa27.08■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
PDSS1-201ENST00000376215 XBP1P17861 261 aa27.07■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 MAPK4P31152 587 aa27.07■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 NLRP5P59047 1200 aa27.07■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 CAP1Q01518 475 aa27.07■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 SP3Q02447 781 aa27.07■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 GPR142Q7Z601 462 aa27.07■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa27.07■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 RIC8AQ9NPQ8 531 aa27.07■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 ADCY7P51828 1080 aa27.06■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 NSMFQ6X4W1 530 aa27.06■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 MEIS2O14770 477 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 CFBP00751 764 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 HSD17B4P51659 736 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 GHRHRQ02643 423 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 TRIM29Q14134 588 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 USP17L6PQ6QN14 398 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 MCF2L2Q86YR7 1114 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 RGS22Q8NE09 1264 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 CUL5Q93034 780 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 C6orf50Q9HD87 102 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF236Q9UL36 1845 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 MMP1P03956 469 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 SYT1P21579 422 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 UBE2SQ16763 222 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 SLC30A10Q6XR72 485 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 CYP39A1Q9NYL5 469 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa27.05■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 RPS6P62753 249 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
PDSS1-201ENST00000376215 RNF207Q6ZRF8 634 aa27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms