RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 RAPGEF1Q13905 1077 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 EEF2KMTQ96G04 330 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 PRR29P0C7W0 189 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 C16orf86Q6ZW13 317 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 SULF1Q8IWU6 871 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 ERLIN1O75477 346 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 POTEJP0CG39 1038 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 TRIML1Q8N9V2 468 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 ANAPC4Q9UJX5 808 aa11.18□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 TMCO5BA8MYB1 307 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 RASA1P20936 1047 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 DDR1Q08345 913 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF569Q5MCW4 686 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 BARHL2Q9NY43 387 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 MEIS1O00470 390 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 PSMD14O00487 310 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 ZBTB5O15062 677 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC42Q96M95 316 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 B4DLN1 442 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 PLCG1P19174 1290 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 ST3GAL1Q11201 340 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 TTBK2Q6IQ55 1244 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 RPL13P26373 211 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 MCF2L2Q86YR7 1114 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 SLFN14P0C7P3 912 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 SHC4Q6S5L8 630 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 MYO6Q9UM54 1294 aa11.17□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 USP17L15C9J2P7 530 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 USP17L11C9JVI0 530 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 USP17L18D6R9N7 530 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 USP17L22D6RA61 530 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 USP17L19D6RCP7 530 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 USP17L20D6RJB6 530 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 SRGNP10124 158 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 USP17L24Q0WX57 530 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 TEKT3Q9BXF9 490 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 PTPREP23469 700 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 HARSP12081 509 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 POTEDQ86YR6 584 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 PHF20Q9BVI0 1012 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 MCM6Q14566 821 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 MCTP2Q6DN12 878 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 NCAPG2Q86XI2 1143 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF577Q9BSK1 485 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 TCHPQ9BT92 498 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 PHACTR2O75167 634 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 CUL4BQ13620 913 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 LRCH2Q5VUJ6 765 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 SPATA1Q5VX52 437 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 CYP26C1Q6V0L0 522 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 ANO3Q9BYT9 981 aa11.16□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 MACROD2A1Z1Q3 448 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 KRT83P78385 493 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 LRRC41Q15345 812 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 TMCO3Q6UWJ1 677 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 AK8Q96MA6 479 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 FAM170AA1A519 330 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 FOXN1O15353 648 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 TRIM14Q14142 442 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 FAM102BQ5T8I3 360 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 LRRC8AQ8IWT6 810 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 MYOCDQ8IZQ8 938 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 CAPZA3Q96KX2 299 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 CTAGE9A4FU28 777 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 CETN3O15182 167 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 GRIPAP1Q4V328 841 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 NLRX1Q86UT6 975 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 DISP2A7MBM2 1401 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 PP2D1A8MPX8 630 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 GSDMAQ96QA5 445 aa11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TTPAL-202ENST00000372904 NT5C2P49902 561 aa11.15□□□□□ -0.63
TTPAL-202ENST00000372904 SMTNP53814 917 aa11.15□□□□□ -0.63
TTPAL-202ENST00000372904 USP14P54578 494 aa11.15□□□□□ -0.63
TTPAL-202ENST00000372904 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms