RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368309.3

UBQLN4-201, Transcript of ubiquilin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN4, Length 3,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4-201ENST00000368309 PLA2G4AP47712 749 aa20.31■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 COA7Q96BR5 231 aa20.31■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 B4DLN1 442 aa20.31■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 ZBTB22O15209 634 aa20.31■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 GTF2IP78347 998 aa20.31■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 ASIC1P78348 528 aa20.31■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 TERF2Q15554 542 aa20.31■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.31■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.31■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 GOLGA1Q92805 767 aa20.31■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 TRIM9Q9C026 710 aa20.31■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 GYS1P13807 737 aa20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 TTI2Q6NXR4 508 aa20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 POTEDQ86YR6 584 aa20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 LGALS16A8MUM7 142 aa20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 TFR2Q9UP52 801 aa20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 PLCG2P16885 1265 aa20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 CHMP4BP1P59074 171 aa20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 CRY2Q49AN0 593 aa20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 CDC23Q9UJX2 597 aa20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 CTAGE9A4FU28 777 aa20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 ARHGAP25P42331 645 aa20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 ST5P78524 1137 aa20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 TRIM14Q14142 442 aa20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 RABGGTAQ92696 567 aa20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 EXOC1Q9NV70 894 aa20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 SASH3O75995 380 aa20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 KLK7P49862 253 aa20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 THAP9Q9H5L6 903 aa20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.29■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 MYH8P13535 1937 aa20.28■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 AK8Q96MA6 479 aa20.28■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 MYL1P05976 194 aa20.28■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 PDHBP11177 359 aa20.28■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.28■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 NDUFA10O95299 355 aa20.28■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 ZBTB9Q96C00 473 aa20.28■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.28■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 CERKQ8TCT0 537 aa20.27■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 CERS3Q8IU89 383 aa20.27■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 P2RX5Q93086 422 aa20.27■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.27■□□□□ 0.84
UBQLN4-201ENST00000368309 BBOX1O75936 387 aa20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 TBC1D8O95759 1140 aa20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 AKR1B1P15121 316 aa20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 MXD3Q9BW11 206 aa20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 SBF2Q86WG5 1849 aa20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 SLURP2P0DP57 97 aa20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 WDR59Q6PJI9 974 aa20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 SLF2Q8IX21 1173 aa20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 CUEDC2Q9H467 287 aa20.26■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 TDP2O95551 362 aa20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 CCNE1P24864 410 aa20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 DYMQ7RTS9 669 aa20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 SLC37A4O43826 429 aa20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 DNM2P50570 870 aa20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 CALML4Q96GE6 196 aa20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 GAKO14976 1311 aa20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 A0A1W2PQC6 194 aa20.25■□□□□ 0.83
UBQLN4-201ENST00000368309 MCM6Q14566 821 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms