RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 SORCS2Q96PQ0 1159 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-407P-201ENST00000365280 CRBNQ96SW2 442 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC9A7Q96T83 725 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLCD4Q9BRC7 762 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-407P-201ENST00000365280 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-407P-201ENST00000365280 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-407P-201ENST00000365280 GINM1Q9NU53 330 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-407P-201ENST00000365280 SMPD4Q9NXE4 827 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-407P-201ENST00000365280 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-407P-201ENST00000365280 TCFL5Q9UL49 500 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-407P-201ENST00000365280 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A087WZG4 1122 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM82A0PJX8 343 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 CASP7P55210 303 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 EIF6P56537 245 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 USHBP1Q8N6Y0 703 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC16A11Q8NCK7 471 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 SHDQ96IW2 340 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 FOXP3Q9BZS1 431 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 ANTXR1Q9H6X2 564 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGSF5Q9NSI5 407 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 EFR3BQ9Y2G0 817 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 FADS2P1A8MWK0 482 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 NUDT19A8MXV4 375 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 ITGB3P05106 788 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 GSNP06396 782 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 BMP8BP34820 402 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 HMGA2P52926 109 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 NCKAP1LP55160 1127 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 AUHQ13825 339 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 VWA3BQ502W6 1294 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 TNNI3KQ59H18 835 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 NT5DC1Q5TFE4 455 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 CPZQ66K79 652 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 LIPIQ6XZB0 460 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 UNC5AQ6ZN44 842 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 VPS37DQ86XT2 251 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 C7orf61Q8IZ16 206 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 TTC9BQ8N6N2 239 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC43A3Q8NBI5 491 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 TCTN2Q96GX1 697 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRDM14Q9GZV8 571 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 CAPN10Q9HC96 672 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 CHST7Q9NS84 486 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 PPT2Q9UMR5 302 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 FHOD1Q9Y613 1164 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 IRS2Q9Y4H2 1338 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 SHOXO15266 292 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF205O95201 554 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRAMEF1O95521 474 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 FSHBP01225 129 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 SYPP08247 313 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 MSL3P1P0C860 447 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 LIMS1P48059 325 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 MAPKAPK2P49137 400 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 NASPP49321 788 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 CYP4F8P98187 520 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 NR1I3Q14994 352 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 RPTNQ6XPR3 784 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMC3Q7Z5M5 1100 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 FERMT3Q86UX7 667 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 PPFIBP1Q86W92 1011 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 GMLQ99445 158 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 TINF2Q9BSI4 451 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 ACBD3Q9H3P7 528 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 PODXL2Q9NZ53 605 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 SUSD2Q9UGT4 822 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1W2PQH9 124 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1W2PQY0 241 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 SH3D21A4FU49 640 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 C9IYK1 514 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 E9PSI1 815 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 FKTNO75072 461 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 NAT2P11245 290 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 ITGA4P13612 1032 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRKCAP17252 672 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 CNR2P34972 360 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 GDF5P43026 501 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 GJA9P57773 515 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-407P-201ENST00000365280 TCEAL1Q15170 157 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms