RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 NUP98P52948 1817 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SMCO2A6NFE2 343 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ERLIN2O94905 339 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 BFSP2Q13515 415 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ASPRV1Q53RT3 343 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PRR16Q569H4 304 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CST9Q5W186 159 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC83Q8IWF9 413 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SCFD2Q8WU76 684 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ANO3Q9BYT9 981 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 GINM1Q9NU53 330 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TPRP12270 2363 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 RASSF10A6NK89 507 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TBCAO75347 108 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ARPP19P56211 112 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 MAP2K5Q13163 448 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 GRIK5Q16478 980 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 MIER3Q7Z3K6 550 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 KCNG4Q8TDN1 519 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 C7orf43Q8WVR3 580 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 LZTS2Q9BRK4 669 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PANK2Q9BZ23 570 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 NUB1Q9Y5A7 615 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SBF2Q86WG5 1849 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PHACTR2O75167 634 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TPM2P07951 284 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ELF1P32519 619 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 APOBRQ0VD83 1088 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 NCAPH2Q6IBW4 605 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZUG5 572 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD23Q86SG2 305 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 FERMT3Q86UX7 667 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 JMYQ8N9B5 988 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CALML4Q96GE6 196 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 IFT74Q96LB3 600 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP4P98171 946 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 FAM110CQ1W6H9 321 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ODR4Q5SWX8 454 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CXCL17Q6UXB2 119 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SESTD1Q86VW0 696 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF654Q8IZM8 581 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 NLRP7Q8WX94 980 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM87BQ96K49 555 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 IGFLR1Q9H665 355 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CERS4Q9HA82 394 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 POLR3EQ9NVU0 708 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 EN2P19622 333 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 C12orf60Q5U649 245 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 DPH6Q7L8W6 267 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 GPR142Q7Z601 462 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 USP37Q86T82 979 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CDAN1Q8IWY9 1227 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PIGSQ96S52 555 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 WDR11Q9BZH6 1224 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 UNC93B1Q9H1C4 597 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PARP2Q9UGN5 583 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TACC3Q9Y6A5 838 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF35A5YM69 484 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 GGPS1O95749 300 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 GNRH1P01148 92 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 THPOP40225 353 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CPT1AP50416 773 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 NEDD9Q14511 834 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 OTOP2Q7RTS6 562 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TPH2Q8IWU9 490 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CHST13Q8NET6 341 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 AGBL1Q96MI9 1066 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D32Q96NH3 1257 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 APBA2Q99767 749 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ADPGKQ9BRR6 497 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 NACA2Q9H009 215 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf49Q9H6J7 331 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC39Q9UFE4 941 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 C10orf71Q711Q0 1435 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 EP400Q96L91 3159 aa5.02□□□□□ -1.61
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