RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298317.8

RPUSD4-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-201ENST00000298317 C8orf74Q6P047 294 aa15.02■□□□□ -0
RPUSD4-201ENST00000298317 NFRKBQ6P4R8 1299 aa15.02■□□□□ -0
RPUSD4-201ENST00000298317 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
RPUSD4-201ENST00000298317 PLA2G12BQ9BX93 195 aa15.02■□□□□ -0
RPUSD4-201ENST00000298317 GDF3Q9NR23 364 aa15.02■□□□□ -0
RPUSD4-201ENST00000298317 A0A1W2PQJ5 194 aa15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 USO1O60763 962 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 MDH1P40925 334 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 KLK7P49862 253 aa15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 FUT2Q10981 343 aa15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 PPP2R5BQ15173 497 aa15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 IL17AQ16552 155 aa15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 CCDC96Q2M329 555 aa15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 FIGNQ5HY92 759 aa15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 CFAP58Q5T655 872 aa15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 PIK3R5Q8WYR1 880 aa15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 MIEF2Q96C03 454 aa15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 SLC40A1Q9NP59 571 aa15.02□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 GSG1L2A8MUP6 293 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 MBD4O95243 580 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 CABP4P57796 275 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 BIRC2Q13490 618 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 SPA17Q15506 151 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 CEP85LQ5SZL2 805 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 MLXIPQ9HAP2 919 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 ALS2Q96Q42 1657 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 PRDM1O75626 825 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 MOCS3O95396 460 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 SCP2P22307 547 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 NF2P35240 595 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 CCDC181Q5TID7 509 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 TTI2Q6NXR4 508 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 VGLL2Q8N8G2 317 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 TRIM47Q96LD4 638 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 EHD2Q9NZN4 543 aa15.01□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 SEC24CP53992 1094 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 KCNB1Q14721 858 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 IFT20Q8IY31 132 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 CCDC42Q96M95 316 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 ALS2CR12Q96Q35 445 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 POLD4Q9HCU8 107 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 RTL9Q8NET4 1388 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 LCA5LO95447 670 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 PAFAH1B1P43034 410 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 IFT88Q13099 833 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 SEC23AQ15436 765 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 CCDC155Q8N6L0 562 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 MAGEC3Q8TD91 643 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 VEZTQ9HBM0 779 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 ODF2LQ9ULJ1 636 aa15□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 DOCK2Q92608 1830 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 GLI1P08151 1106 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 FAM153BP0C7A2 387 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 CXCR5P32302 372 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 CARSP49589 748 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 PAK2Q13177 524 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 FAM153CQ494X1 144 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 IQCA1Q86XH1 822 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 ARMT1Q9H993 441 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 KLHL33A6NCF5 533 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 PSMA7O14818 248 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 PHKA1P46020 1223 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 TRAPPC10P48553 1259 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 C3orf20Q8ND61 904 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RPUSD4-201ENST00000298317 NFU1Q9UMS0 254 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms