RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 SNX14Q9Y5W7 946 aa29.08■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 FRMPD3Q5JV73 1810 aa29.08■■■□□ 2.25
CXCL2-201ENST00000296031 NFIBO00712 420 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 DDAH1O94760 285 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 CNTN2Q02246 1040 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 QRICH1Q2TAL8 776 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 FAM133AQ8N9E0 248 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 TCEANC2Q96MN5 208 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 MAP3K14Q99558 947 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 CYP39A1Q9NYL5 469 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 MCM3APO60318 1980 aa29.06■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 LHX8Q68G74 356 aa29.06■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa29.06■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 CLEC4DQ8WXI8 215 aa29.06■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 FGD4Q96M96 766 aa29.06■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 USP26Q9BXU7 913 aa29.06■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 NRBP1Q9UHY1 535 aa29.06■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 SGMS1Q86VZ5 419 aa29.05■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 OGDHLQ9ULD0 1010 aa29.05■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 SLC12A7Q9Y666 1083 aa29.05■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 LCTP09848 1927 aa29.04■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa29.04■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 KIF5BP33176 963 aa29.04■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 FBXO11Q86XK2 927 aa29.04■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 MTMR8Q96EF0 704 aa29.04■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 RIOX1Q9H6W3 641 aa29.04■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 PTPDC1A2A3K4 754 aa29.03■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 MSCO60682 206 aa29.03■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 CALM1P0DP23 149 aa29.03■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 CALM2P0DP24 149 aa29.03■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 CALM3P0DP25 149 aa29.03■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 SLC35G1Q2M3R5 365 aa29.03■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 CNPY2Q9Y2B0 182 aa29.03■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 ABCB11O95342 1321 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 SOWAHBA6NEL2 793 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 ZBTB5O15062 677 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 SEPT4O43236 478 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 CPA1P15085 419 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 HOMER1Q86YM7 354 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa29.02■■■□□ 2.24
CXCL2-201ENST00000296031 CYTH3O43739 400 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 RXRAP19793 462 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 ANO1Q5XXA6 986 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 SLC30A10Q6XR72 485 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 RNF207Q6ZRF8 634 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 ARMCX2Q7L311 632 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 ANKLE1Q8NAG6 615 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 AMNQ9BXJ7 453 aa29.01■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 CALML3P27482 149 aa29■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 PSMA5P28066 241 aa29■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa29■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 RGS22Q8NE09 1264 aa29■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 PIGSQ96S52 555 aa29■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 LZTS2Q9BRK4 669 aa29■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa29■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 GNAQP50148 359 aa28.99■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 FGD1P98174 961 aa28.99■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 MICU3Q86XE3 530 aa28.99■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 ASTN1O14525 1302 aa28.98■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 ASB14A6NK59 587 aa28.98■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 SMARCA1P28370 1054 aa28.98■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 RPS6P62753 249 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 FANCBQ8NB91 859 aa28.98■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 PIBF1Q8WXW3 757 aa28.98■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 MAF1Q9H063 256 aa28.98■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa28.97■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 PLEKHA8P1O95397 391 aa28.97■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 TRAF1Q13077 416 aa28.97■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 APOA5Q6Q788 366 aa28.97■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 MCF2L2Q86YR7 1114 aa28.97■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 SPZ1Q9BXG8 430 aa28.97■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa28.97■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 BRPF3Q9ULD4 1205 aa28.97■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa28.97■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 CASTP20810 708 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 RPS6KB1P23443 525 aa28.96■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 ACVR2BQ13705 512 aa28.96■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 NECAB2Q7Z6G3 386 aa28.96■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CXCL2-201ENST00000296031 LRRC37A2A6NM11 1700 aa28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.8 ms