RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 SEC24CP53992 1094 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 PAK2Q13177 524 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 NUP58Q9BVL2 599 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 PLCG1P19174 1290 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 IRAK1P51617 712 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 KIF11P52732 1056 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 CHRNDQ07001 517 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 KLHL30Q0D2K2 578 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 PICALMQ13492 652 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 KRT79Q5XKE5 535 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 MSL1Q68DK7 614 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 PNMA1Q8ND90 353 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 EXOC5O00471 708 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 DYNLL2Q96FJ2 89 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 RFX7Q2KHR2 1363 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 VIMP08670 466 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 APBA1Q02410 837 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 AP1M1Q9BXS5 423 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 RAB34Q9BZG1 259 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 GPCPD1Q9NPB8 672 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRN-201ENST00000295718 LGALS16A8MUM7 142 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 MYO1FO00160 1098 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 TNNC1P63316 161 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 P2RX5Q93086 422 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 ARL8AQ96BM9 186 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 NBPF3Q9H094 633 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 WNT7AO00755 349 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 MYZAPP0CAP1 466 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 MGARPQ8TDB4 240 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 MAP2K7O14733 419 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 MYBL2P10244 700 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 TCP1P17987 556 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 CASP7P55210 303 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 ZBED6P86452 979 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 PLS1Q14651 629 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 CNNM4Q6P4Q7 775 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 SPATA4Q8NEY3 305 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 GOLPH3Q9H4A6 298 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 USP17L3A6NCW0 530 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 USP17L4A6NCW7 530 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 ABCB4P21439 1286 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 SSR1P43307 286 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 USP17L1Q7RTZ2 530 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 DAAM2Q86T65 1068 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 TBC1D5Q92609 795 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 C6orf50Q9HD87 102 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 DISC1Q9NRI5 854 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 ATG3Q9NT62 314 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 XDHP47989 1333 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 SMCO2A6NFE2 343 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 TULP2O00295 520 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 USP17L8P0C7I0 530 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 IFNAR2P48551 515 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 MSANTD4Q8NCY6 345 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 PMS1P54277 932 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 CORO7P57737 925 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 RPS6KA1Q15418 735 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 MCTP2Q6DN12 878 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 VPS36Q86VN1 386 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 KCND1Q9NSA2 647 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 PSD3Q9NYI0 1048 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 STIM2Q9P246 746 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 MROH5Q6ZUA9 1318 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 EZRP15311 586 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 EPHB4P54760 987 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 CCDC155Q8N6L0 562 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 OR2W6PQ8NHA6 318 aa16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF76P36508 570 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 SFMBT2Q5VUG0 894 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 DNAAF5Q86Y56 855 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRN-201ENST00000295718 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms