RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VWA5AO00534 786 aa27.33■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OPLAHO14841 1288 aa27.33■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DSG3P32926 999 aa27.33■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COG2Q14746 738 aa27.33■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPAT2Q6NUI2 795 aa27.33■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SAPCD2Q86UD0 394 aa27.33■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MS4A4AQ96JQ5 239 aa27.33■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USP28Q96RU2 1077 aa27.33■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPRYD7Q5W111 196 aa27.32■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DAGLBQ8NCG7 672 aa27.32■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BRMS1Q9HCU9 246 aa27.32■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C6orf50Q9HD87 102 aa27.32■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ESYT2A0FGR8 921 aa27.32■■□□□ 1.96
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TOMM70O94826 608 aa27.32■■□□□ 1.96
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADCY7P51828 1080 aa27.32■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa27.32■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PGBD1Q96JS3 809 aa27.32■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa27.32■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPP1R18Q6NYC8 613 aa27.31■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 REPS2Q8NFH8 660 aa27.31■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLIC4Q9Y696 253 aa27.31■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP2B1P20020 1258 aa27.3■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa27.3■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USP17L6PQ6QN14 398 aa27.3■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PSTPIP2Q9H939 334 aa27.3■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RIC8AQ9NPQ8 531 aa27.3■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RCOR1Q9UKL0 485 aa27.3■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCPG1Q9ULG6 757 aa27.3■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa27.3■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ICAM1P05362 532 aa27.3■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GAS2L3Q86XJ1 694 aa27.3■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBC1D5Q92609 795 aa27.3■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GNA11P29992 359 aa27.29■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GALNT17Q6IS24 598 aa27.29■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RASAL3Q86YV0 1011 aa27.29■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BRI3BPQ8WY22 251 aa27.29■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZBED4O75132 1171 aa27.28■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM132BQ14DG7 1078 aa27.28■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TPRNQ4KMQ1 711 aa27.28■■□□□ 1.96
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RIPK3Q9Y572 518 aa27.28■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa27.27■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCL15Q16663 113 aa27.27■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa27.27■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MEIS2O14770 477 aa27.27■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ALAS1P13196 640 aa27.27■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HOXC10Q9NYD6 342 aa27.27■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TLL2Q9Y6L7 1015 aa27.27■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GTF2A2P52657 109 aa27.26■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC183Q5T5S1 534 aa27.26■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa27.26■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BTBD19C9JJ37 291 aa27.25■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RGMBQ6NW40 437 aa27.25■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RTEL1Q9NZ71 1219 aa27.25■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BTBD7Q9P203 1132 aa27.25■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa27.25■■□□□ 1.95
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CETPP11597 493 aa27.25■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 INF2Q27J81 1249 aa27.25■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CLEC4DQ8WXI8 215 aa27.25■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTPN18Q99952 460 aa27.25■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYPNQ86TC9 1320 aa27.24■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYP2C8P10632 490 aa27.24■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HERVK_113P62684 666 aa27.24■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BICD2Q8TD16 824 aa27.24■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABCB11O95342 1321 aa27.23■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYCE3A1L190 88 aa27.23■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CFBP00751 764 aa27.23■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLS1Q14651 629 aa27.23■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANO1Q5XXA6 986 aa27.23■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM43AQ8N2R8 423 aa27.23■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GRPEL1Q9HAV7 217 aa27.23■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
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