RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 CHP1Q99653 195 aa31.4■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 PPP1R2P41236 205 aa31.4■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 ZNF662Q6ZS27 426 aa31.4■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 ZNF287Q9HBT7 754 aa31.4■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 MYO6Q9UM54 1294 aa31.4■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 JAG2Q9Y219 1238 aa31.4■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 USP17L3A6NCW0 530 aa31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 USP17L4A6NCW7 530 aa31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 USP17L1Q7RTZ2 530 aa31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 HDXQ7Z353 690 aa31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 KRT27Q7Z3Y8 459 aa31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 KRT25Q7Z3Z0 450 aa31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 CERS3Q8IU89 383 aa31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 SPZ1Q9BXG8 430 aa31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 ZMYND12Q9H0C1 365 aa31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 GBP3Q9H0R5 595 aa31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 ERICH4A6NGS2 130 aa31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 RETREG2Q8NC44 543 aa31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 NUP58Q9BVL2 599 aa31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 LEMD3Q9Y2U8 911 aa31.39■■■□□ 2.62
UBP1-201ENST00000283628 BICDL2A1A5D9 508 aa31.38■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 PSMD14O00487 310 aa31.38■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 SRGNP10124 158 aa31.38■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 GPS2Q13227 327 aa31.38■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 PNKPQ96T60 521 aa31.38■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 TMEM47Q9BQJ4 181 aa31.38■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 LDHCP07864 332 aa31.37■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 MEA1Q16626 185 aa31.37■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 FLT1P17948 1338 aa31.37■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 OR52Z1P0C646 297 aa31.37■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 KRT83P78385 493 aa31.37■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 CABP7Q86V35 215 aa31.37■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 FAM114A1Q8IWE2 563 aa31.37■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 TXLNBQ8N3L3 684 aa31.37■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 CNBD1Q8NA66 436 aa31.37■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 EXOC1Q9NV70 894 aa31.36■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 RASA1P20936 1047 aa31.36■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 CCNE1P24864 410 aa31.36■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa31.36■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 EHBP1Q8NDI1 1231 aa31.36■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 STX8Q9UNK0 236 aa31.36■■■□□ 2.61
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UBP1-201ENST00000283628 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 C7orf25Q9BPX7 421 aa31.35■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa31.35■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 KLRF2D3W0D1 207 aa31.34■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 GYS1P13807 737 aa31.34■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 PLCG1P19174 1290 aa31.34■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 GRAPQ13588 217 aa31.34■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP31.34■■■□□ 2.612e-6■■□□□ 12.8
UBP1-201ENST00000283628 WDR59Q6PJI9 974 aa31.34■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa31.34■■■□□ 2.61
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UBP1-201ENST00000283628 P2RX5Q93086 422 aa31.34■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 GUCA1BQ9UMX6 200 aa31.34■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 L1RE1Q9UN81 338 aa31.34■■■□□ 2.61
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UBP1-201ENST00000283628 TRIM9Q9C026 710 aa31.34■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 TTYH3Q9C0H2 523 aa31.34■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 C6orf50Q9HD87 102 aa31.34■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa31.34■■■□□ 2.61
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UBP1-201ENST00000283628 AMPD3Q01432 767 aa31.33■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 COBLL1Q53SF7 1204 aa31.33■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 PRR5LQ6MZQ0 368 aa31.33■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 ZNF804AQ7Z570 1209 aa31.33■■■□□ 2.61
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UBP1-201ENST00000283628 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
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UBP1-201ENST00000283628 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
UBP1-201ENST00000283628 B4DLN1 442 aa31.32■■■□□ 2.6
UBP1-201ENST00000283628 TRIM37O94972 964 aa31.32■■■□□ 2.6
UBP1-201ENST00000283628 HERVK_113P62684 666 aa31.32■■■□□ 2.6
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UBP1-201ENST00000283628 CCDC170Q8IYT3 715 aa31.32■■■□□ 2.6
UBP1-201ENST00000283628 PSD3Q9NYI0 1048 aa31.32■■■□□ 2.6
UBP1-201ENST00000283628 RHOXF2BP0C7M4 288 aa31.31■■■□□ 2.6
UBP1-201ENST00000283628 PDE4DQ08499 809 aa31.31■■■□□ 2.6
UBP1-201ENST00000283628 DIXDC1Q155Q3 683 aa31.31■■■□□ 2.6
UBP1-201ENST00000283628 WDR93Q6P2C0 686 aa31.31■■■□□ 2.6
UBP1-201ENST00000283628 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
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UBP1-201ENST00000283628 EXOC4Q96A65 974 aa31.31■■■□□ 2.6
UBP1-201ENST00000283628 IQCDQ96DY2 449 aa31.31■■■□□ 2.6
UBP1-201ENST00000283628 RHOXF2Q9BQY4 288 aa31.31■■■□□ 2.6
UBP1-201ENST00000283628 ABCB6Q9NP58 842 aa31.31■■■□□ 2.6
UBP1-201ENST00000283628 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa31.31■■■□□ 2.6
UBP1-201ENST00000283628 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
UBP1-201ENST00000283628 NEK8Q86SG6 692 aa31.31■■■□□ 2.6
UBP1-201ENST00000283628 KRT86O43790 486 aa31.3■■■□□ 2.6
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