RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MTMR8Q96EF0 704 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BTBD7Q9P203 1132 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 REPS2Q8NFH8 660 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PARP14Q460N5 1801 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYPNQ86TC9 1320 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZBED4O75132 1171 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP28Q96RU2 1077 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF536O15090 1300 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZBTB5O15062 677 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNMDO75829 334 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRHR2Q13324 411 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LBX2Q6XYB7 198 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLS1Q14651 629 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SHISA4Q96DD7 197 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CPA4Q9UI42 421 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 Q3C1V9 767 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USH1GQ495M9 461 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COA7Q96BR5 231 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BTBD18B2RXH4 712 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CA12O43570 354 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRPA1O75762 1119 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBC1D8O95759 1140 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRT2P35908 639 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WWC2Q6AWC2 1192 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FBXO11Q86XK2 927 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNF186Q9NXI6 227 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ICAM1P05362 532 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MB21D1Q8N884 522 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RIPK3Q9Y572 518 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TLR2O60603 784 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 YEATS4O95619 227 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ALDH1A1P00352 501 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FDX1P10109 184 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STAT3P40763 770 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ALAS1P13196 640 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CALML3P27482 149 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERVK-9P63128 1117 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERVK-24P63145 666 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GSE1Q14687 1217 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AMNQ9BXJ7 453 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANO1Q5XXA6 986 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OXER1Q8TDS5 423 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BARHL2Q9NY43 387 aa23.29■■□□□ 1.32
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