RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254190.3

CHSY1-201, Transcript of chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHSY1, Length 4,550 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1-201ENST00000254190 TBCKQ8TEA7 893 aa26.42■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 RNF40O75150 1001 aa26.42■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 LIN9Q5TKA1 542 aa26.42■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 TAOK1Q7L7X3 1001 aa26.42■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.42■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 PIGBQ92521 554 aa26.42■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.41■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 EXOC7Q9UPT5 735 aa26.41■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 GOLGA8KD6RF30 607 aa26.41■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 PPFIA4O75335 1185 aa26.41■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa26.41■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.41■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 MSANTD4Q8NCY6 345 aa26.41■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 TEKT1Q969V4 418 aa26.41■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 DCUN1D2Q6PH85 259 aa26.41■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 EPC1Q9H2F5 836 aa26.41■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 RWDD2AQ9UIY3 292 aa26.41■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 KRT15P19012 456 aa26.41■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 FAM178BQ8IXR5 827 aa26.41■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 PANX2Q96RD6 677 aa26.41■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 TRIM7Q9C029 511 aa26.41■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 EXOC3L4Q17RC7 722 aa26.4■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 ABCB6Q9NP58 842 aa26.4■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 TERF2Q15554 542 aa26.4■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.4■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 MADDQ8WXG6 1647 aa26.39■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 EPB41L5Q9HCM4 733 aa26.39■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 CDC27P30260 824 aa26.39■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 KMT5BQ4FZB7 885 aa26.39■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 CUEDC2Q9H467 287 aa26.39■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 STK24Q9Y6E0 443 aa26.39■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CHSY1-201ENST00000254190 NR2F2P24468 414 aa26.39■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.39■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 CROCCP2Q86T23 111 aa26.39■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 MFAP3LO75121 409 aa26.39■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 GAS8O95995 478 aa26.39■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 C2orf54Q08AI8 447 aa26.39■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 CASP8Q14790 479 aa26.39■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 RETREG2Q8NC44 543 aa26.39■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 GLI2P10070 1586 aa26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 ZBED6P86452 979 aa26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 DIXDC1Q155Q3 683 aa26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 DOK7Q18PE1 504 aa26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 OXER1Q8TDS5 423 aa26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 CD19P15391 556 aa26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 CCNE1P24864 410 aa26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 COA7Q96BR5 231 aa26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 KCNF1Q9H3M0 494 aa26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 PLCG1P19174 1290 aa26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 CCDC127Q96BQ5 260 aa26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 PIGSQ96S52 555 aa26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 NEDD4P46934 1319 aa26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 IFNB1P01574 187 aa26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 MAN2A1Q16706 1144 aa26.38■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 A0A1B0GUA9 196 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 STRN3Q13033 797 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 AK8Q96MA6 479 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 MAGEF1Q9HAY2 307 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 FAM184BQ9ULE4 1060 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 USP17L3A6NCW0 530 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 USP17L4A6NCW7 530 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 FOXN1O15353 648 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 FTCDO95954 541 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 TRPC3Q13507 836 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 SCARF1Q14162 830 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 ERFEQ4G0M1 354 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 KSR1Q8IVT5 923 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.37■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 LAD1O00515 517 aa26.36■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 MOCS3O95396 460 aa26.36■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 FERP16591 822 aa26.36■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 TNNI1P19237 187 aa26.36■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 SUSD4Q5VX71 490 aa26.36■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 ABCC12Q96J65 1359 aa26.36■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 ATP11AP98196 1134 aa26.36■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CHSY1-201ENST00000254190 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms