RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225603.8

CBX1-201, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-201ENST00000225603 TREML2Q5T2D2 321 aa20.62■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 CHADLQ6NUI6 762 aa20.62■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.62■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 ZNF536O15090 1300 aa20.62■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 OPLAHO14841 1288 aa20.61■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 STK38Q15208 465 aa20.61■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 CST9Q5W186 159 aa20.61■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 ATG4CQ96DT6 458 aa20.61■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 PPIL2Q13356 520 aa20.61■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.61■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.61■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.61■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.61■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 PTPRFP10586 1907 aa20.61■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.6■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 USP17L15C9J2P7 530 aa20.6■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.6■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 USP17L11C9JVI0 530 aa20.6■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 USP17L18D6R9N7 530 aa20.6■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 USP17L22D6RA61 530 aa20.6■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.6■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 USP17L19D6RCP7 530 aa20.6■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 USP17L20D6RJB6 530 aa20.6■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 YEATS4O95619 227 aa20.6■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 USP17L24Q0WX57 530 aa20.6■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.6■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 CUL5Q93034 780 aa20.6■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.6■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 CXCL11O14625 94 aa20.59■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 SLC39A14Q15043 492 aa20.59■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 INF2Q27J81 1249 aa20.59■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 BICD2Q8TD16 824 aa20.59■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 RLFQ13129 1914 aa20.59■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 SPTLC2O15270 562 aa20.59■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 ZNF174Q15697 407 aa20.59■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.59■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.59■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 ESPNB1AK53 854 aa20.58■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 VWA5AO00534 786 aa20.58■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 DSG3P32926 999 aa20.58■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 FKBP1BP68106 108 aa20.58■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 MOGSQ13724 837 aa20.58■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 CPXCR1Q8N123 301 aa20.58■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.58■□□□□ 0.89
CBX1-201ENST00000225603 MEIS2O14770 477 aa20.58■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 ICAM1P05362 532 aa20.58■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 COG2Q14746 738 aa20.58■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 TTC38Q5R3I4 469 aa20.58■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.58■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.58■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 TBC1D5Q92609 795 aa20.58■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 PARP14Q460N5 1801 aa20.58■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 ME1P48163 572 aa20.57■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.57■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.57■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.57■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 EDIL3O43854 480 aa20.57■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 RNF214Q8ND24 703 aa20.57■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 REPS2Q8NFH8 660 aa20.57■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.57■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 UNCXA6NJT0 531 aa20.56■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 TRAPPC10P48553 1259 aa20.56■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.56■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 TBCKQ8TEA7 893 aa20.56■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 ZBED4O75132 1171 aa20.55■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 CLCN1P35523 988 aa20.55■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 MCM7P33993 719 aa20.55■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 KIF3CO14782 793 aa20.54■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 PEX10O60683 326 aa20.54■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.54■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 ABCB11O95342 1321 aa20.54■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.54■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.54■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 PPP6R2O75170 966 aa20.54■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 LIG1P18858 919 aa20.54■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 GRIN1Q05586 938 aa20.54■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.54■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 CLIC6Q96NY7 704 aa20.54■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.54■□□□□ 0.88
CBX1-201ENST00000225603 ALAS1P13196 640 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms