RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ugt1a7cQ6ZQM8 531 aa26.16■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Bst2Q8R2Q8 172 aa26.16■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Krt34Q9D646 392 aa26.16■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 ThbdP15306 577 aa26.16■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc84Q4VA36 332 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Krt87Q6IMF0 495 aa26.16■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Oxsr1Q6P9R2 527 aa26.16■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fbxo10Q7TQF2 950 aa26.16■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Scfd2Q8BTY8 684 aa26.16■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gpsm2Q8VDU0 679 aa26.16■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa26.16■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 SisF8VQM5 1818 aa26.16■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Eif5P59325 429 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa26.15■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gbp7Q91Z40 638 aa26.15■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Wdr78E9PYY5 807 aa26.15■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nr1i2O54915 431 aa26.15■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Psg29Q3URN6 468 aa26.15■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zhx2Q8C0C0 836 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Defb15Q8R2I5 79 aa26.15■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 ArcQ9WV31 396 aa26.15■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rps12P63323 132 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Hvcn1Q3U2S8 269 aa26.14■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 CtcfQ61164 736 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Phf20Q8BLG0 1010 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cabp7Q91ZM8 215 aa26.14■■□□□ 1.78
Suds3-201ENSMUST00000086471 Serpina16D3Z660 418 aa26.14■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tph1P17532 447 aa26.14■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cep135Q6P5D4 1140 aa26.14■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mapk4Q6P5G0 583 aa26.14■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dcaf8Q8N7N5 591 aa26.14■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 NyxP83503 476 aa26.13■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Stxbp3Q60770 592 aa26.13■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 RragbQ6NTA4 374 aa26.13■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Morc2bQ8C5W4 1022 aa26.13■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 CluhQ5SW19 1315 aa26.13■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc2a13Q3UHK1 637 aa26.13■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tshz1Q5DTH5 1084 aa26.13■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 GapdhsQ64467 440 aa26.13■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 En2P09066 324 aa26.12■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Hoxa11P31311 313 aa26.12■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pcif1P59114 706 aa26.12■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Igf2bp2Q5SF07 592 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rgl1Q60695 768 aa26.11■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ildr1Q8CBR1 537 aa26.11■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Taf6lQ8R2K4 616 aa26.11■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q91WD4 421 aa26.11■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dctpp1Q9QY93 170 aa26.11■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cspp1B2RX88 1205 aa26.1■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Krt39Q6IFX4 482 aa26.1■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa26.1■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cmtm5Q9D6G9 156 aa26.1■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nedd1P33215 660 aa26.1■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Stat3P42227 770 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa26.1■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slu7Q8BHJ9 585 aa26.1■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Parp2O88554 559 aa26.09■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pla2g4bP0C871 782 aa26.09■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nek1P51954 1203 aa26.09■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mmp20P57748 482 aa26.09■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gprin1Q3UNH4 932 aa26.09■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Chaf1aQ9QWF0 911 aa26.09■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zc3h7bF8VPP8 982 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tesk2Q8VCT9 570 aa26.09■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 F11Q91Y47 624 aa26.09■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sapcd2Q9D818 391 aa26.09■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 LdhbP16125 334 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gprasp2Q8BUY8 826 aa26.08■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mindy4Q3UQI9 744 aa26.08■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Grik5Q61626 979 aa26.08■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Plcg2Q8CIH5 1265 aa26.08■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tlcd1Q99JT6 247 aa26.08■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ankrd1Q9CR42 319 aa26.08■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 EhhadhQ9DBM2 718 aa26.08■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cbx6Q9DBY5 414 aa26.08■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prl2c5Q9JLV9 222 aa26.08■■□□□ 1.77
Suds3-201ENSMUST00000086471 AU015836B2RUM3 263 aa26.07■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 EzrP26040 586 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Bri3bpQ8BXV2 253 aa26.07■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Setdb2Q8C267 713 aa26.07■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pnma3Q8JZW8 466 aa26.07■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa26.07■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 MycnP03966 462 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lrch1P62046 709 aa26.07■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ankk1Q8BZ25 745 aa26.07■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fgl2P12804 432 aa26.06■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lrrc36Q3V0M2 755 aa26.06■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Acat1Q8QZT1 424 aa26.06■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ubiad1Q9DC60 336 aa26.06■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Map7d1A2AJI0 846 aa26.06■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tal1P22091 329 aa26.06■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Irf6P97431 467 aa26.06■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vgll2Q8BGW8 322 aa26.06■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arl6ip4Q9JM93 229 aa26.06■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 B3galt4Q9Z0F0 371 aa26.06■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 XdhQ00519 1335 aa26.06■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr832Q7TRG9 312 aa26.05■■□□□ 1.76
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nop14Q8R3N1 860 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.2 ms