RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	IMG1	P25626	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YEL043W	P32618	956 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YME1	P32795	747 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	TUL1	P36096	758 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	MUP3	P38734	546 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	ELO1	P39540	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	PCL7	P40186	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	NAS2	P40555	220 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	PMT6	P42934	759 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	AAT1	Q01802	451 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	PLM2	Q04383	521 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	UAF30	Q08747	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	FRE3	Q08905	711 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	VPS54	Q12071	889 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	SPE2	P21182	396 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	PPH22	P23595	377 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	MRPL9	P31334	269 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	GMH1	P36125	273 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	ICS2	P38284	255 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	MSR1	P38714	643 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	WSS1	P38838	269 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	NDC80	P40460	691 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	YFR020W	P43600	232 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	PTR3	P43606	678 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	SMC3	P47037	1230 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	YGL138C	P53122	345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	RAD33	Q04231	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	CDA2	Q06703	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	AIM39	Q08223	395 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	PSY3	Q12318	242 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	BOS1	P25385	244 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	NUP133	P36161	1157 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	PIM1	P36775	1133 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	PPS1	P38148	807 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	YSW1	P38280	609 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	NET1	P47035	1189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	URB2	P47108	1174 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	MLC1	P53141	149 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	SKO1	Q02100	647 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	WAR1	Q03631	944 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	TAP42	Q04372	366 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	PCL8	Q08966	492 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	NTO1	Q12311	748 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	PET111	P08468	800 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	OMA1	P36163	345 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	STU2	P46675	888 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	YGR149W	P48236	432 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	FMS1	P50264	508 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	HST1	P53685	503 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	ACL4	Q03771	387 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	PPM1	Q04081	328 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	MGR3	Q04472	501 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	HRD3	Q05787	833 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	RTT109	Q07794	436 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	MLH2	Q07980	695 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	SIL1	Q08199	421 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	DAP2	P18962	818 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	PTC6	P25646	442 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	GLG1	P36143	616 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	TSC10	P38342	320 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	SUL1	P38359	859 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	SER3	P40054	469 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	COS5	P47187	383 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	PHO23	P50947	330 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	ALT2	P52892	507 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	YNR068C	P53754	272 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	SPH1	Q06160	661 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPS0B	YLR048W	COS7	Q07788	383 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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