RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W SSE2P32590 693 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
NTF2YER009W YIL169CP40442 995 aa3.13□□□□□ -1.91
NTF2YER009W RTS2P40962 232 aa3.13□□□□□ -1.91
NTF2YER009W YGR127WP53275 312 aa3.13□□□□□ -1.91
NTF2YER009W SOL4P53315 255 aa3.13□□□□□ -1.91
NTF2YER009W LSC1P53598 329 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
NTF2YER009W RSM23Q01163 450 aa3.13□□□□□ -1.91
NTF2YER009W NUP100Q02629 959 aa3.13□□□□□ -1.91
NTF2YER009W SMA1Q02651 245 aa3.13□□□□□ -1.91
NTF2YER009W NUP53Q03790 475 aa3.13□□□□□ -1.91
NTF2YER009W IMH1Q06704 911 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
NTF2YER009W APL5Q08951 932 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
NTF2YER009W FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
NTF2YER009W BUD5P25300 642 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W BOS1P25385 244 aa3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W SGF29P25554 259 aa3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W IMG1P25626 169 aa3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W YBR144CP34215 104 aa3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W MTR2P34232 184 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W NUP133P36161 1157 aa3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W ICS2P38284 255 aa3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W EFM2P38347 419 aa3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data3.12□□□□□ -1.91not detected
NTF2YER009W RGI2P40188 164 aa3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W FET5P43561 622 aa3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W MRX6P48564 524 aa3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W PYK2P52489 506 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W RSF1Q05043 376 aa3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W YLR281CQ05863 155 aa3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W YEH1Q07804 573 aa3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W CTI6Q08923 506 aa3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W RCN2Q12044 265 aa3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W YPT6Q99260 215 aa3.12□□□□□ -1.91
NTF2YER009W HNM1P19807 563 aa3.11□□□□□ -1.91
NTF2YER009W PEP3P27801 918 aa3.11□□□□□ -1.91
NTF2YER009W YKL100CP34248 587 aa3.11□□□□□ -1.91
NTF2YER009W UBP11P36026 717 aa3.11□□□□□ -1.91
NTF2YER009W RPL32P38061 130 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
NTF2YER009W ROT2P38138 954 aa3.11□□□□□ -1.91
NTF2YER009W RKM3P38222 552 aa3.11□□□□□ -1.91
NTF2YER009W ERG7P38604 731 aa3.11□□□□□ -1.91
NTF2YER009W CCT6P39079 546 aa3.11□□□□□ -1.91
NTF2YER009W APT1P49435 187 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
NTF2YER009W FMP42Q04991 504 aa3.11□□□□□ -1.91
NTF2YER009W BSC1Q12140 328 aa3.11□□□□□ -1.91
NTF2YER009W MED1Q12321 566 aa3.11□□□□□ -1.91
NTF2YER009W GCN4P03069 281 aa3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W MRP13P12686 339 aa3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W MET8P15807 274 aa3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W EST1P17214 699 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W MCM4P30665 933 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W RAD24P32641 659 aa3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W TIF3P34167 436 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W PHD1P36093 366 aa3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W YBR225WP38321 900 aa3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W LAG1P38703 411 aa3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W MAF1P41910 395 aa3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W HOS2P53096 452 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W ARE2P53629 642 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W VPS75P53853 264 aa3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W MSC1Q03104 513 aa3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W YMR160WQ03823 816 aa3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W YLR352WQ06479 807 aa3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W YJR112W-AQ3E743 109 aa3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W SGS1P35187 1447 aa3.1□□□□□ -1.91
NTF2YER009W CBS1P14066 229 aa3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W HSC82P15108 705 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W ART10P18634 518 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W SNC1P31109 117 aa3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W RPN2P32565 945 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W SEF1P34228 1148 aa3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W REG2P38232 338 aa3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W YND1P40009 630 aa3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W SAD1P43589 448 aa3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W ATG27P46989 271 aa3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W VID30P53076 958 aa3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W SMM1P53720 384 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W DUG3P53871 357 aa3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W IPI3P53877 555 aa3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W VPS72Q03388 795 aa3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W SSK1Q07084 712 aa3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W TAH18Q12181 623 aa3.09□□□□□ -1.91
NTF2YER009W BAR1P12630 587 aa3.08□□□□□ -1.92
NTF2YER009W RPS2P25443 254 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
NTF2YER009W SPC34P36131 295 aa3.08□□□□□ -1.92
NTF2YER009W BZZ1P38822 633 aa3.08□□□□□ -1.92
NTF2YER009W CIN4P39110 191 aa3.08□□□□□ -1.92
NTF2YER009W NPR2P39923 615 aa3.08□□□□□ -1.92
NTF2YER009W ALG5P40350 334 aa3.08□□□□□ -1.92
NTF2YER009W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.08□□□□□ -1.92not detected
NTF2YER009W YIR014WP40570 242 aa3.08□□□□□ -1.92
NTF2YER009W AXL1P40851 1208 aa3.08□□□□□ -1.92
NTF2YER009W AZF1P41696 914 aa3.08□□□□□ -1.92
NTF2YER009W SNG1P46950 547 aa3.08□□□□□ -1.92
NTF2YER009W YGR066CP53242 292 aa3.08□□□□□ -1.92
NTF2YER009W YGR126WP53274 230 aa3.08□□□□□ -1.92
NTF2YER009W TIM10P87108 93 aa3.08□□□□□ -1.92
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