RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637887.1

ARID1B-231, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5

Gene ARID1B, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-231	ENST00000637887	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		8.03	□□□□□ -1.12
ARID1B-231	ENST00000637887	PRR13	Q9NZ81	148 aa		8.03	□□□□□ -1.12
ARID1B-231	ENST00000637887	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		8.03	□□□□□ -1.12
ARID1B-231	ENST00000637887	GSN	P06396	782 aa		8.02	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		8.02	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		8.02	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		8.02	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		8.02	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	BRF1	Q92994	677 aa		8.02	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	8.02	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	8.02	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	8.01	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887		H0Y8X5	98 aa		8.01	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	GUCY2C	P25092	1073 aa		8.01	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	VIPR1	P32241	457 aa		8.01	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF445	P59923	1031 aa		8.01	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	SSPN	Q14714	243 aa		8.01	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	8.01	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	8.01	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	GINM1	Q9NU53	330 aa		8.01	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	8.01	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	GSTM1	P09488	218 aa		8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	PRKCA	P17252	672 aa		8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	PAK2	Q13177	524 aa		8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	JMJD8	Q96S16	334 aa		8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	GP6	Q9HCN6	339 aa		8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	SMARCA2	P51531	1590 aa		8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	EPHB3	P54753	998 aa		8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	ERVFRD-1	P60508	538 aa		8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	NUP43	Q8NFH3	380 aa		8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	KCTD3	Q9Y597	815 aa		8	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	7.99	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887		A0A1W2PQY0	241 aa		7.99	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		7.99	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	7.99	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	7.99	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	PANK1	Q8TE04	598 aa		7.99	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		7.99	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		7.99	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		7.99	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		7.99	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	HRK	O00198	91 aa		7.98	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	MPO	P05164	745 aa		7.98	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	CD247	P20963	164 aa		7.98	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	VAMP1	P23763	118 aa		7.98	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	CYP4F8	P98187	520 aa		7.98	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		7.98	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	FIBCD1	Q8N539	461 aa		7.98	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	NAT16	Q8N8M0	369 aa		7.98	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		7.98	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	7.98	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	INHBB	P09529	407 aa		7.97	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	PI3	P19957	117 aa		7.97	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	ARL4A	P40617	200 aa		7.97	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	LAPTM5	Q13571	262 aa		7.97	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		7.97	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		7.97	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		7.97	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	EEA1	Q15075	1411 aa		7.97	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		7.97	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	NUDT19	A8MXV4	375 aa		7.96	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		7.96	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF385B	Q569K4	471 aa		7.96	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		7.96	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	CRBN	Q96SW2	442 aa		7.96	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		7.96	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.13
ARID1B-231	ENST00000637887	N4BP3	O15049	544 aa		7.95	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	CBFA2T2	O43439	604 aa		7.95	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	MSL3P1	P0C860	447 aa		7.95	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	CDR1	P51861	262 aa		7.95	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	MVK	Q03426	396 aa		7.95	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	LILRA6	Q6PI73	481 aa		7.95	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	7.95	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		7.95	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	IRAK3	Q9Y616	596 aa		7.95	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	ABLIM1	O14639	778 aa		7.94	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	ITGA4	P13612	1032 aa		7.94	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	SOX9	P48436	509 aa		7.94	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	7.94	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	TMC6	Q7Z403	805 aa		7.94	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	GPRASP2	Q96D09	838 aa		7.94	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		7.94	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	7.94	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		7.94	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	RFXAP	O00287	272 aa		7.94	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	7.94	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	CD3E	P07766	207 aa		7.94	□□□□□ -1.14
ARID1B-231	ENST00000637887	IFNGR1	P15260	489 aa		7.94	□□□□□ -1.14

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms