RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636868.1

ATRX-222, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-222	ENST00000636868	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	RGL3	Q3MIN7	710 aa		5	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		5	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		5	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		5	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	CD248	Q9HCU0	757 aa		5	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	USP17L7	P0C7H9	530 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	KLHL3	Q9UH77	587 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	PRR5	P85299	388 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868		A0A1W2PQ27	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868		A0A1W2PQ64	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868		A0A1W2PQC6	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868		A0A1W2PQD8	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	LMO1	P25800	156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	DSC3	Q14574	896 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	ALG3	Q92685	438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	SETDB2	Q96T68	719 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATRX-222	ENST00000636868	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	KIF2C	Q99661	725 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	GIPC1	O14908	333 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	PML	P29590	882 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	FBF1	Q8TES7	1133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	C12orf49	Q9H741	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	MEIS1	O00470	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	MUSK	O15146	869 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	SIGLEC6	O43699	453 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	ZNF205	O95201	554 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	RNF4	P78317	190 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868		A0A1W2PQJ5	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	GPR42	O15529	346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	GBP1	P32455	592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	SELENOP	P49908	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	LIG3	P49916	1009 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	FAM124A	Q86V42	546 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	TREH	O43280	583 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	DNAJA2	O60884	412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	TACR1	P25103	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-222	ENST00000636868	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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