RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 OPTNQ96CV9 577 aa22.87■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.86■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 C19orf81C9J6K1 198 aa22.86■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 IRF6O14896 467 aa22.86■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 SLC16A2P36021 539 aa22.86■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 HMGCS2P54868 508 aa22.86■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.86■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.86■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.86■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 TMEM232C9JQI7 657 aa22.85■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 CTAGE5O15320 804 aa22.85■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.85■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 BRAPQ7Z569 592 aa22.85■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 LPAR1Q92633 364 aa22.85■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.85■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.85■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 STK36Q9NRP7 1315 aa22.84■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 SMARCA1P28370 1054 aa22.84■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 PLCB2Q00722 1185 aa22.84■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 PPIL2Q13356 520 aa22.84■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.84■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.84■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 PARP14Q460N5 1801 aa22.83■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 CAVIN2O95810 425 aa22.83■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 VCAM1P19320 739 aa22.83■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 ME1P48163 572 aa22.83■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 HUNKP57058 714 aa22.83■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.83■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 AIFM3Q96NN9 605 aa22.83■■□□□ 1.25
CLN8-208ENST00000635751 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 DEXIO95424 95 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 GJA5P36382 358 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 C12orf42Q96LP6 360 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 CXCL11O14625 94 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 AP5Z1O43299 807 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 PKN1Q16512 942 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 CBX8Q9HC52 389 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 STAT2P52630 851 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 LUZP1Q86V48 1076 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 HOMER1Q86YM7 354 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 PIGSQ96S52 555 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 ALG1Q9BT22 464 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 KINO60870 393 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 YEATS4O95619 227 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 WNK4Q96J92 1243 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 RLFQ13129 1914 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 TPM3P06753 285 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 FSIP1Q8NA03 581 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 FEM1BQ9UK73 627 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 A0A1W2PQ27 194 aa22.79■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 A0A1W2PQ64 194 aa22.79■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 A0A1W2PQD8 194 aa22.79■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 FSTL1Q12841 308 aa22.79■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.79■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 ADALQ6DHV7 355 aa22.79■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.79■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.79■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 WASF1Q92558 559 aa22.79■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.79■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.79■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 PLA2G6O60733 806 aa22.78■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 STK38Q15208 465 aa22.78■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CLN8-208ENST00000635751 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms