RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621218.4

PLP1-223, Transcript of proteolipid protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLP1, Length 3,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLP1-223	ENST00000621218	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	FAM228A	Q86W67	206 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	SYNE4	Q8N205	404 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	CAVIN3	Q969G5	261 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ESYT3	A0FGR9	886 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	SMIM22	K7EJ46	135 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	NCK2	O43639	380 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	MOCS3	O95396	460 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	GLI1	P08151	1106 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ELF1	P32519	619 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	SMTN	P53814	917 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	KIF5A	Q12840	1032 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	NPY5R	Q15761	445 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	IQCE	Q6IPM2	695 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	MIEF2	Q96C03	454 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	RUFY1	Q96T51	708 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	NAPB	Q9H115	298 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ABCC12	Q96J65	1359 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	PPP1R37	O75864	691 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	VAV2	P52735	878 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ITIH3	Q06033	890 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	NEDD9	Q14511	834 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	TRADD	Q15628	312 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	PTGIS	Q16647	500 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ADSSL1	Q8N142	457 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	FAM89A	Q96GI7	184 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	MS4A14	Q96JA4	679 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ARMT1	Q9H993	441 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	NFU1	Q9UMS0	254 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	MEGF6	O75095	1541 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	KIF1A	Q12756	1690 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	SRGN	P10124	158 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	PDHB	P11177	359 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	KRT2	P35908	639 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	CCDC96	Q2M329	555 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	WLS	Q5T9L3	541 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	TNFRSF25	Q93038	417 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	CENPH	Q9H3R5	247 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	MBD4	O95243	580 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	NR1D1	P20393	614 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	PHKA1	P46020	1223 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ALX1	Q15699	326 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	EMC10	Q5UCC4	262 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	NLRP14	Q86W24	1093 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	TRIM58	Q8NG06	486 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ORAI2	Q96SN7	254 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218		A6NNZ2	444 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	DNM1L	O00429	736 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	FUT2	Q10981	343 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	TTC38	Q5R3I4	469 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	SH2D4A	Q9H788	454 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	PRLR	P16471	622 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	DNM2	P50570	870 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	METTL24	Q5JXM2	366 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	DCAF5	Q96JK2	942 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	KRT23	Q9C075	422 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms