RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619037.1

CYFIP1-209, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene CYFIP1, Length 575 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-209ENST00000619037 JMJD4Q9H9V9 463 aa15.2■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 RIPK3Q9Y572 518 aa15.2■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 ATP2A1O14983 1001 aa15.19■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 CYTH3O43739 400 aa15.19■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 ERCC3P19447 782 aa15.19■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 MAPK4P31152 587 aa15.19■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 OAZ1P54368 228 aa15.19■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 RTN1Q16799 776 aa15.19■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 RIOX2Q8IUF8 465 aa15.19■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 CCDC82Q8N4S0 544 aa15.19■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 PIBF1Q8WXW3 757 aa15.19■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 HPS5Q9UPZ3 1129 aa15.19■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 TRIM17Q9Y577 477 aa15.19■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 CDC27P30260 824 aa15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 GNAQP50148 359 aa15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 EVCP57679 992 aa15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 STK3Q13188 491 aa15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 ARHGEF6Q15052 776 aa15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 TMTC3Q6ZXV5 915 aa15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 OTOP1Q7RTM1 612 aa15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 GPR142Q7Z601 462 aa15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 HOMER1Q86YM7 354 aa15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 PIGSQ96S52 555 aa15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 RIOX1Q9H6W3 641 aa15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 HOMER2Q9NSB8 354 aa15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 CCPG1Q9ULG6 757 aa15.18■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 PLXNB2O15031 1838 aa15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 SLC25A27O95847 323 aa15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 ICAM1P05362 532 aa15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 ALAS1P13196 640 aa15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 ADD1P35611 737 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 RCAN1P53805 252 aa15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 CCT2P78371 535 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 USH1GQ495M9 461 aa15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 PLEKHH3Q7Z736 793 aa15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 SHCBP1Q8NEM2 672 aa15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 COA7Q96BR5 231 aa15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 MROH8Q9H579 483 aa15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 GABRQQ9UN88 632 aa15.17■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 MYH6P13533 1939 aa15.16■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 PRKCZQ05513 592 aa15.16■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 RABEP1Q15276 862 aa15.16■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 ANKRD1Q15327 319 aa15.16■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 MTMR8Q96EF0 704 aa15.16■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 SPZ1Q9BXG8 430 aa15.16■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 RNF146Q9NTX7 359 aa15.16■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa15.16■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 NID2Q14112 1375 aa15.15■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa15.15■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 ZBTB5O15062 677 aa15.15■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 GNRH1P01148 92 aa15.15■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 PTPREP23469 700 aa15.15■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 HOXD10P28358 340 aa15.15■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 COPB2P35606 906 aa15.15■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 MUM1L1Q5H9M0 696 aa15.15■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 FBXO11Q86XK2 927 aa15.15■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 TRERF1Q96PN7 1200 aa15.15■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 SRRDQ9UH36 339 aa15.15■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 SMCHD1A6NHR9 2005 aa15.15■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.15■□□□□ 0.02
CYFIP1-209ENST00000619037 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 PPFIA3O75145 1194 aa15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 LARGE1O95461 756 aa15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 SMARCA1P28370 1054 aa15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 FLT3LGP49771 235 aa15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 PPP2R5BQ15173 497 aa15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 TKFCQ3LXA3 575 aa15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 MORN1Q5T089 497 aa15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 CHST13Q8NET6 341 aa15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 MMP19Q99542 508 aa15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 NUDT12Q9BQG2 462 aa15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 ACAD9Q9H845 621 aa15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 GJD2Q9UKL4 321 aa15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.14■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.13■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 SLC15A5A6NIM6 579 aa15.13■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 STRNO43815 780 aa15.13■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 FCER1AP12319 257 aa15.13■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 CYP2B6P20813 491 aa15.13■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 ADORA2AP29274 412 aa15.13■□□□□ 0.01
CYFIP1-209ENST00000619037 FUT2Q10981 343 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms