RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	SNX12	Q9UMY4	172 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	TNS2	Q63HR2	1409 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	GMNC	A6NCL1	334 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	SRGAP2	O75044	1071 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	ATP1A2	P50993	1020 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	MEA1	Q16626	185 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	KRT40	Q6A162	431 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	AIDA	Q96BJ3	306 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	GSDMA	Q96QA5	445 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	NOD2	Q9HC29	1040 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	GLI3	P10071	1580 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF233	A6NK53	670 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	C2orf54	Q08AI8	447 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	E2F5	Q15329	346 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	ALG1	Q9BT22	464 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958		A0A1W2PQC6	194 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958		E7EVH7	732 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	TRAPPC3	O43617	180 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	RAB27A	P51159	221 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	MFN1	Q8IWA4	741 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	TRIM58	Q8NG06	486 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	KRT31	Q15323	416 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF827	Q17R98	1081 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	IFT20	Q8IY31	132 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	GDF3	Q9NR23	364 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	CFAP73	A6NFT4	308 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	N4BP3	O15049	544 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	IDE	P14735	1019 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	PAK2	Q13177	524 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	KCNB1	Q14721	858 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	WHAMM	Q8TF30	809 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	CCT6B	Q92526	530 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	RNF14	Q9UBS8	474 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	STK36	Q9NRP7	1315 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	PPIP5K2	O43314	1243 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	SEC24C	P53992	1094 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC38	Q502W7	563 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	MSL1	Q68DK7	614 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	CNKSR1	Q969H4	720 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	CHP1	Q99653	195 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	ITGB4	P16144	1822 aa		11.91	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	PRC1	O43663	620 aa		11.9	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
CPEB1-215	ENST00000617958	KRT14	P02533	472 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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