RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612154.4

SORCS1-209, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SORCS1, Length 6,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-209ENST00000612154 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
SORCS1-209ENST00000612154 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SORCS1-209ENST00000612154 USTQ9Y2C2 406 aa7.34□□□□□ -1.23
SORCS1-209ENST00000612154 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.34□□□□□ -1.23
SORCS1-209ENST00000612154 USP17L5A8MUK1 530 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 SARNPP82979 210 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 AOC3Q16853 763 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 SPICE1Q8N0Z3 855 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 SERPINB13Q9UIV8 391 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 SYT1P21579 422 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 PIK3CAP42336 1068 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 KCNJ6P48051 423 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 ARMCX5Q6P1M9 558 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 MIGA2Q7L4E1 593 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 C7orf31Q8N865 590 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 SDR42E1Q8WUS8 393 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 PCDHA12Q9UN75 941 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 SEC24BO95487 1268 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 TUBBP07437 444 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 LRCH2Q5VUJ6 765 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 SYCE1Q8N0S2 351 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 MYL10Q9BUA6 226 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 COL15A1P39059 1388 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 KIF28PB7ZC32 967 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 FDX1P10109 184 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 PRPSAP1Q14558 356 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 NELFCDQ8IXH7 590 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 WRNIP1Q96S55 665 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 OPA1O60313 960 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 PODNQ7Z5L7 613 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 THEM5Q8N1Q8 247 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 IL17REQ8NFR9 667 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 TCP11Q8WWU5 503 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 FAM167AQ96KS9 214 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 MMP19Q99542 508 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 FAM107BQ9H098 131 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 PIDD1Q9HB75 910 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 DENND3A2RUS2 1198 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 E7EWF7 191 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 SRGAP2BP0DMP2 458 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 SCG2P13521 617 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 GOLGA8FQ08AF8 430 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 LGSNQ5TDP6 509 aa7.33□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 OR52Z1P0C646 297 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 CRKP46108 304 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 CYP2J2P51589 502 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 MYO1EQ12965 1108 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 NBPF11Q86T75 865 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 FAM81BQ96LP2 452 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 SLF1Q9BQI6 1058 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 ATG3Q9NT62 314 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 IRAK4Q9NWZ3 460 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 VPS54Q9P1Q0 977 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 FEM1BQ9UK73 627 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 TNKSO95271 1327 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 KCNQ3O43525 872 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 MYL5Q02045 173 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 SURF1Q15526 300 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 KRT40Q6A162 431 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 TMEM179Q6ZVK1 233 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 YAF2Q8IY57 180 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 WDR64B1ANS9 1081 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 KCNQ4P56696 695 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 DCAF4Q8WV16 495 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 FAM227BQ96M60 508 aa7.32□□□□□ -1.24
SORCS1-209ENST00000612154 UIMC1Q96RL1 719 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms