RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.87■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.87■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 VCPKMTQ9H867 229 aa22.87■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 PARP14Q460N5 1801 aa22.87■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 CSF2RAP15509 400 aa22.86■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.86■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 KCNA10Q16322 511 aa22.86■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF365Q70YC5 407 aa22.86■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 HERVK_113Q902F9 699 aa22.86■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.86■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 TMX2Q9Y320 296 aa22.86■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 PGK2P07205 417 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 STAT3P40763 770 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 TDO2P48775 406 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 CDK8P49336 464 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 ICA1Q05084 483 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 ADGRE1Q14246 886 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 RILPL2Q969X0 211 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 IL23AQ9NPF7 189 aa22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 SBK1Q52WX2 424 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.84■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 ARVCFO00192 962 aa22.83■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 FGBP02675 491 aa22.83■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 CDK7P50613 346 aa22.83■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.83■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.83■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC17Q96LX7 622 aa22.83■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.83■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.83■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 BMP1P13497 986 aa22.82■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 AKR1B1P15121 316 aa22.82■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.82■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.82■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 ASGR1P07306 291 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
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SGMS1-208ENST00000608287 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.81■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 GBF1Q92538 1859 aa22.8■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 ACRP10323 421 aa22.8■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 FAM227BQ96M60 508 aa22.8■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 NAPBQ9H115 298 aa22.8■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.8■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.8■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 COG5Q9UP83 839 aa22.8■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 VWA5AO00534 786 aa22.79■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 TICAM2Q86XR7 235 aa22.79■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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SGMS1-208ENST00000608287 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.79■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.79■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.79■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 A0A0D9SFI3 127 aa22.78■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 CABYRO75952 493 aa22.78■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 PDE4AP27815 886 aa22.78■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 GJA9P57773 515 aa22.78■■□□□ 1.24
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SGMS1-208ENST00000608287 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.78■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.78■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.78■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.78■■□□□ 1.24
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SGMS1-208ENST00000608287 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.77■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 HIPK3Q9H422 1215 aa22.77■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.77■■□□□ 1.24
SGMS1-208ENST00000608287 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 SDSP20132 328 aa22.76■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 RASA1P20936 1047 aa22.76■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 VPS53Q5VIR6 699 aa22.76■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.76■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 FOXP2O15409 715 aa22.75■■□□□ 1.23
SGMS1-208ENST00000608287 CD4P01730 458 aa22.75■■□□□ 1.23
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