RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP38.53■■■■□ 3.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 EVCP57679 992 aa38.53■■■■□ 3.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR78Q5VTH9 848 aa38.53■■■■□ 3.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC174Q6PII3 467 aa38.53■■■■□ 3.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCAPG2Q86XI2 1143 aa38.53■■■■□ 3.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa38.53■■■■□ 3.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ICAM1P05362 532 aa38.52■■■■□ 3.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHH3Q7Z736 793 aa38.52■■■■□ 3.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 LZTS2Q9BRK4 669 aa38.51■■■■□ 3.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 JMJD4Q9H9V9 463 aa38.51■■■■□ 3.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRRDQ9UH36 339 aa38.51■■■■□ 3.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP38.5■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGBL1Q96MI9 1066 aa38.5■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIOX1Q9H6W3 641 aa38.5■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP38.5■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 PNMA2Q9UL42 364 aa38.5■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIPK3Q9Y572 518 aa38.5■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa38.5■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYH6P13533 1939 aa38.5■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLGA8BA8MQT2 603 aa38.49■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMARCA1P28370 1054 aa38.49■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIF2CQ99661 725 aa38.49■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 VAT1LQ9HCJ6 419 aa38.49■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEK4P51957 841 aa38.48■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP2R5BQ15173 497 aa38.48■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 NBPF11Q86T75 865 aa38.48■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCPG1Q9ULG6 757 aa38.48■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLXNB2O15031 1838 aa38.48■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLGA8AA7E2F4 631 aa38.48■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYTH3O43739 400 aa38.48■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC4A3P48751 1232 aa38.48■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 RTN1Q16799 776 aa38.48■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOCS4Q8WXH5 440 aa38.48■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTMR8Q96EF0 704 aa38.48■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBC1D32Q96NH3 1257 aa38.48■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPZ1Q9BXG8 430 aa38.48■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 STRNO43815 780 aa38.47■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP38.47■■■■□ 3.754e-6■□□□□ 8.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKCZQ05513 592 aa38.47■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD1Q15327 319 aa38.47■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35G1Q2M3R5 365 aa38.47■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP38.47■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 NID2Q14112 1375 aa38.46■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHA8P1O95397 391 aa38.46■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTPREP23469 700 aa38.46■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 TKFCQ3LXA3 575 aa38.46■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMTC3Q6ZXV5 915 aa38.46■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHST13Q8NET6 341 aa38.46■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 GJD2Q9UKL4 321 aa38.46■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 HPS5Q9UPZ3 1129 aa38.46■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTPN22Q9Y2R2 807 aa38.46■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 QRICH1Q2TAL8 776 aa38.45■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP38.45■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDT12Q9BQG2 462 aa38.45■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXO40Q9UH90 709 aa38.45■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 GABRQQ9UN88 632 aa38.45■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMCHD1A6NHR9 2005 aa38.45■■■■□ 3.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALAS1P13196 640 aa38.44■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 FLT3LGP49771 235 aa38.44■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRB14Q14449 540 aa38.44■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABRAQ8N0Z2 381 aa38.44■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP38.44■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa38.43■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC15A5A6NIM6 579 aa38.43■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBTB5O15062 677 aa38.43■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 AK2P54819 239 aa38.43■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 MORN1Q5T089 497 aa38.43■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 HOMER2Q9NSB8 354 aa38.43■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF236Q9UL36 1845 aa38.43■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 FCER1AP12319 257 aa38.43■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRERF1Q96PN7 1200 aa38.43■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACAD9Q9H845 621 aa38.43■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF146Q9NTX7 359 aa38.43■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP38.42■■■■□ 3.741e-10■■■□□ 14.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 HOMER1Q86YM7 354 aa38.42■■■■□ 3.74
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDC27P30260 824 aa38.41■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 IRF5Q13568 498 aa38.41■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIGSQ96S52 555 aa38.41■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 MMP19Q99542 508 aa38.41■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCTD2Q14681 263 aa38.4■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXO11Q86XK2 927 aa38.4■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAET1EQ8TD07 263 aa38.4■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP6NLQ92738 828 aa38.4■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa38.4■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADORA2AP29274 412 aa38.39■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP2K5Q13163 448 aa38.39■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMNQ9BXJ7 453 aa38.39■■■■□ 3.74
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCOLN1Q9GZU1 580 aa38.39■■■■□ 3.74
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