RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568875.1

SNAPC5-208, Transcript of small nuclear RNA activating complex polypeptide 5, human

TSL 2

Gene SNAPC5, Length 1,741 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAPC5-208	ENST00000568875	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	VWA5A	O00534	786 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	NMT2	O60551	498 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	HMGCR	P04035	888 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	GJA8	P48165	433 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	MAP2K5	Q13163	448 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	REPS2	Q8NFH8	660 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	TRIB2	Q92519	343 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	ZNF213	O14771	459 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	STRN	O43815	780 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	ERCC3	P19447	782 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	RGS2	P41220	211 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	TRIM32	Q13049	653 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	GRB14	Q14449	540 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	ME3	Q16798	604 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	SLFN13	Q68D06	897 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875		A0A0G2JMZ2	1700 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	OFD1	O75665	1012 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	LARGE1	O95461	756 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	HOXC6	P09630	235 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	PLS1	Q14651	629 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	GMCL1	Q96IK5	515 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	MROH8	Q9H579	483 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	ELP1	O95163	1332 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	SGPL1	O95470	568 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	SLC25A27	O95847	323 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	BMP3	P12645	472 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	STAT3	P40763	770 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	CCL14	Q16627	93 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	APBA2	Q99767	749 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	FEM1B	Q9UK73	627 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	IGHA2	P01877	340 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	TPM2	P07951	284 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	CPA1	P15085	419 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	RPTOR	Q8N122	1335 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	PLA2G6	O60733	806 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	COBL	O75128	1261 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	ADORA2A	P29274	412 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	DEFB118	Q96PH6	123 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SNAPC5-208	ENST00000568875	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SNAPC5-208	ENST00000568875	TMEM232	C9JQI7	657 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNAPC5-208	ENST00000568875	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SNAPC5-208	ENST00000568875	CAPN2	P17655	700 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNAPC5-208	ENST00000568875	SLC1A4	P43007	532 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNAPC5-208	ENST00000568875	NT5C2	P49902	561 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNAPC5-208	ENST00000568875	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SNAPC5-208	ENST00000568875	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNAPC5-208	ENST00000568875	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNAPC5-208	ENST00000568875	ESR2	Q92731	530 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SNAPC5-208	ENST00000568875	KIFC2	Q96AC6	838 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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