RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRPV1Q8NER1 839 aa20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTMR7Q9Y216 660 aa20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC4A3P48751 1232 aa20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF543Q08ER8 600 aa20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRDNQ13061 729 aa20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 KAT14Q9H8E8 782 aa20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 PFASO15067 1338 aa20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 ICAM1P05362 532 aa20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 PNMA1Q8ND90 353 aa20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNF146Q9NTX7 359 aa20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNKSO95271 1327 aa20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 EVI5O60447 810 aa20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL6A1P12109 1028 aa20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTH1RQ03431 593 aa20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAP4K1Q92918 833 aa20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNM1LO00429 736 aa20.04■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP21A2P08686 494 aa20.04■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALAS1P13196 640 aa20.04■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.04■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC174Q6PII3 467 aa20.04■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.04■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.04■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC16A2P36021 539 aa20.03■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.03■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.03■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.02■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 POTEB2H3BUK9 544 aa20.02■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.02■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.02■□□□□ 0.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 NEFLP07196 543 aa20.01■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 RARBP10826 455 aa20.01■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKR1A1P14550 325 aa20.01■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCOA7Q8NI08 942 aa20.01■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.01■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.01■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 KBTBD13C9JR72 458 aa20■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 E7EWF7 191 aa20■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNAP25P60880 206 aa20■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEC23AQ15436 765 aa20■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 FGD4Q96M96 766 aa20■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAF1Q9H063 256 aa20■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRO3102Q9H379 93 aa20■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP39A1Q9NYL5 469 aa20■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERICH2A1L162 156 aa19.99■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASB14A6NK59 587 aa19.99■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 MUM1L1Q5H9M0 696 aa19.99■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 CASC1Q6TDU7 716 aa19.99■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYB5R4Q7L1T6 521 aa19.99■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM184BQ9ULE4 1060 aa19.99■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALPK3Q96L96 1907 aa19.98■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa19.98■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNTN2Q02246 1040 aa19.98■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACVR2BQ13705 512 aa19.98■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARMCX2Q7L311 632 aa19.98■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa19.98■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 GOLGA8HP0CJ92 632 aa19.97■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC41Q15345 812 aa19.97■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANO1Q5XXA6 986 aa19.97■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 NSMFQ6X4W1 530 aa19.97■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNF180Q86T96 592 aa19.97■□□□□ 0.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms